30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5753 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  94.09 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  78.33 
 
 		 203 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  78.61 
 
 		 199 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  75.72 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  75.72 
 
 		 199 aa  258  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  65.28 
 
 		 159 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  62.94 
 
 		 175 aa  201  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  51.24 
 
 		 189 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  52.13 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  56.85 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  54.23 
 
 		 176 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  52.11 
 
 		 176 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  50.35 
 
 		 171 aa  161  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  52.11 
 
 		 176 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  50.71 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  46.06 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  46.23 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  42.2 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  36.19 
 
 		 123 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  38.68 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  36.7 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  37.27 
 
 		 157 aa  62  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  37.11 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  34.78 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  31.13 
 
 		 139 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  30.77 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 249 aa  48.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0172  hypothetical protein  28.81 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  29.09 
 
 		 137 aa  42  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>