35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2525 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  79.41 
 
 		 134 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  79.41 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  79 
 
 		 127 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  56.41 
 
 		 139 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  50 
 
 		 144 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  55.56 
 
 		 148 aa  121  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  44.09 
 
 		 123 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  39.29 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  33.73 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  37.38 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  34.85 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  34.33 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  33.85 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  40.21 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  36.11 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  35.19 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  35.64 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  34.65 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  27.04 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  31.03 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  36 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  34.58 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  31.03 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  31.03 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  35.87 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  29.13 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  29.13 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2102  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 268 aa  44.7  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.895116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  46.81 
 
 		 525 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  38.46 
 
 		 503 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  39.58 
 
 		 542 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 143 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  39.58 
 
 		 566 aa  41.6  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>