29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1944 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  366  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  90.34 
 
 		 176 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  90.34 
 
 		 176 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  64.38 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  55.94 
 
 		 175 aa  187  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  57.05 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  52.5 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  56.94 
 
 		 203 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  55.94 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  54.93 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  54.23 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  48.15 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  56.69 
 
 		 189 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  54.55 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  54.55 
 
 		 199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  54.23 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  44.14 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  38.41 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  43.14 
 
 		 137 aa  91.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  31.53 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  32.29 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  28.68 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  27.52 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  27.18 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0172  hypothetical protein  27.12 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  26.17 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  29.82 
 
 		 249 aa  47.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  24.04 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  30.89 
 
 		 631 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>