34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5693 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  340  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  75.38 
 
 		 137 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  47.71 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  38.41 
 
 		 176 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  50 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  47.27 
 
 		 203 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  42.4 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  42.4 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  46.36 
 
 		 203 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  46.23 
 
 		 203 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  49.5 
 
 		 181 aa  94  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  45.19 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  44.25 
 
 		 189 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  43.52 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  41.13 
 
 		 226 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  41.9 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  45.16 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  45.16 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  45.16 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  34.01 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  34.38 
 
 		 134 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  34.26 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  36 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  30.85 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 249 aa  52  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  32.67 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  27.07 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  39.24 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0172  hypothetical protein  25.49 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3266  cytochrome c class I  36.17 
 
 		 394 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4456  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 388 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103229  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4590  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 388 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4115  hypothetical protein  35.11 
 
 		 394 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675645  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4251  hypothetical protein  35.11 
 
 		 394 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0931386  normal  0.175621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>