37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3270 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  357  7e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  60 
 
 		 189 aa  191  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  50.32 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  53.79 
 
 		 182 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  47.4 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  52.45 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  51.77 
 
 		 203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  50.35 
 
 		 203 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  51.75 
 
 		 199 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  41.52 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  53.28 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  53.28 
 
 		 199 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  45.09 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  45.09 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  46.32 
 
 		 175 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  44.76 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  44.93 
 
 		 181 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  41.9 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  40.95 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  37.96 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  34.21 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  34.53 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  37.86 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  34.41 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  31.37 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  27.66 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  29.7 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  31.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.31 
 
 		 305 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  31.51 
 
 		 307 aa  41.6  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1087  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.25 
 
 		 304 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.25 
 
 		 304 aa  41.6  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0172  hypothetical protein  24.17 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2001  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.31 
 
 		 325 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.38 
 
 		 322 aa  41.2  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2821  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.25 
 
 		 303 aa  40.8  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>