35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1586 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  100 
 
 		 175 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  62.5 
 
 		 159 aa  224  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  58.08 
 
 		 182 aa  207  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  59.09 
 
 		 203 aa  206  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  62.94 
 
 		 203 aa  201  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  62.24 
 
 		 203 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  55.17 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  61.11 
 
 		 199 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  56.67 
 
 		 189 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  59.44 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  59.44 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  52.41 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  48.15 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  52.99 
 
 		 226 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  47.13 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  51.06 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  51.06 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  43.52 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  40.95 
 
 		 137 aa  84  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  41.51 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  40.74 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  42.34 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  40.18 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  35.92 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  31.73 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  31.73 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  30.84 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2792  cytochrome c, class I  28.7 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.52873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  34.83 
 
 		 418 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0172  hypothetical protein  25.86 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  34.44 
 
 		 418 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  33 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0557  cytochrome c, class I  30.26 
 
 		 683 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  27.68 
 
 		 975 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  27.43 
 
 		 278 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>