35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4973 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  100 
 
 		 148 aa  308  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  54.89 
 
 		 139 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  65.05 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  48.2 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  50.82 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  48.39 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  55.56 
 
 		 199 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  42.39 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  36.9 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  35.9 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  31.9 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  34.78 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  33.91 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  34.21 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  30.84 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  27.07 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  29.2 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  30.43 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  26.17 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  44.9 
 
 		 525 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  28.97 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  28.97 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  31.96 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  31.96 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  31.96 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  42.55 
 
 		 566 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  42.55 
 
 		 542 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  30.09 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  25.23 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  25.23 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  39.06 
 
 		 503 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  43.4 
 
 		 530 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  42.55 
 
 		 493 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0610  putative c-type cytochrome  39.58 
 
 		 493 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>