30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3041 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3041  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  281  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3394  hypothetical protein  71.97 
 
 		 157 aa  200  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.928771  decreased coverage  0.00867638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3107  hypothetical protein  74.56 
 
 		 127 aa  188  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2525  hypothetical protein  79.21 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2426  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (xoxG)  49.6 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00658149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4973  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  48.39 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.437867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6477  putative methanol dehydrogenase-like protein, cytochrome cL (XoxG)  56.38 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633318  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2618  cytochrome c-555  40.43 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1586  putative cytochrome c protein  40.18 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0058  hypothetical protein  31.09 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.771056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3517  hypothetical protein  38.6 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404669  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0509  hypothetical protein  38.05 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0951715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5969  putative cytochrome c protein  39.05 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.657165  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5693  hypothetical protein  34.38 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1780  putative cytochrome c protein  36.8 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218363  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5753  hypothetical protein  38.68 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3942  putative cytochrome c protein  37.84 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5978  hypothetical protein  37.74 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5313  hypothetical protein  36.11 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3270  hypothetical protein  37.14 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100674 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0021  hypothetical protein  36.04 
 
 		 226 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1944  hypothetical protein  31.53 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.388193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0477  cytochrome c protein  36.63 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1237  cytochrome c553i  30.63 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2579  cytochrome c553i  30.63 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1810  hypothetical protein  36.46 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.553149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1762  hypothetical protein  36.46 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2146  hypothetical protein  36.46 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3169  cytochrome d1, heme region  31.34 
 
 		 493 aa  41.2  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  36.07 
 
 		 530 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>