More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1114 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
373 aa  760    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
376 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 
377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
816 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
1138 aa  249  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  49.18 
 
 
1741 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
383 aa  238  9e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.21 
 
 
884 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
389 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
389 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.43 
 
 
1516 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
386 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
386 aa  216  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2928  histidine kinase  49.38 
 
 
455 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
355 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
499 aa  198  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 
533 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
500 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
636 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 
498 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
421 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
541 aa  175  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.32039  normal  0.384329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  31.03 
 
 
667 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3394  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
728 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.99137  normal  0.249099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
679 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
372 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00620911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2493  PAS sensor protein  39.75 
 
 
394 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0714891  decreased coverage  0.00496497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
1258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 
416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.786855  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
644 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
1259 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
405 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 
591 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
378 aa  156  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
625 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
958 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
424 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
815 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  52.74 
 
 
257 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  31.34 
 
 
544 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
436 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  31.04 
 
 
374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  29.67 
 
 
588 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
1010 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
404 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
643 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
885 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
1178 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
372 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
1195 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  35.83 
 
 
1153 aa  143  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
605 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  34.41 
 
 
648 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  29.74 
 
 
578 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.56 
 
 
953 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  38.46 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
646 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  55.73 
 
 
131 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
606 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  32.43 
 
 
371 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  55.4 
 
 
352 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  28.42 
 
 
1152 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  56.56 
 
 
143 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
798 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
484 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.25 
 
 
989 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
1484 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
391 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  53.08 
 
 
130 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  53.08 
 
 
704 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
374 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
391 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3153  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
366 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
397 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
701 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  33.78 
 
 
617 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  33.85 
 
 
629 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  30.53 
 
 
628 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
695 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
600 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
1021 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.25 
 
 
989 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
1120 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
1043 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
1124 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
733 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
1406 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
564 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  48.23 
 
 
603 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
589 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  50 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  33.33 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0330192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.86399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>