More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0558 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  100 
 
 		 380 aa  778    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  70.99 
 
 		 376 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  71.55 
 
 		 405 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  63.9 
 
 		 374 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  61.75 
 
 		 370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  61.22 
 
 		 370 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  62.14 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  57.02 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00181  GTPases  46.28 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.712591  normal  0.906931 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0026  GTPase EngC  49 
 
 		 304 aa  273  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0022  GTPase EngC  48.81 
 
 		 300 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1346  GTPase EngC  45.95 
 
 		 312 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.497247  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00231  GTPase  48.31 
 
 		 321 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00191  GTPase  43.89 
 
 		 313 aa  262  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.0640635 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  46.08 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.52 
 
 		 294 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.89 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.38 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.64 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00181  GTPase  38.02 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00181  GTPases  37.93 
 
 		 305 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.655275  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00181  GTPase  37.31 
 
 		 305 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.14 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  40.67 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0019  GTPase EngC  35.37 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.6 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  40.6 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  39.1 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  38.35 
 
 		 293 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  38.35 
 
 		 293 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.63 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  36.96 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  39.03 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  39.03 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  39.03 
 
 		 293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  39.03 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  39.03 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  39.03 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  39.03 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  40.88 
 
 		 290 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.16 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.56 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.56 
 
 		 295 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.42 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  36.36 
 
 		 294 aa  172  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.15 
 
 		 294 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.64 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  36.26 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  35.9 
 
 		 287 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.19 
 
 		 300 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.09 
 
 		 288 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.98 
 
 		 302 aa  167  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.6 
 
 		 288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.45 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.2 
 
 		 306 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.69 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.52 
 
 		 282 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.11 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.64 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  35.74 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  32.79 
 
 		 290 aa  156  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.88 
 
 		 319 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  37.7 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  37.7 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  33.45 
 
 		 311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  36.03 
 
 		 306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  32.26 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  36.9 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  34.93 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.07 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  32.78 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  34.21 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.64 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 340 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.71 
 
 		 316 aa  140  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.92 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.02 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  37.35 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  31.34 
 
 		 307 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  32.7 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  31.91 
 
 		 347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  38.31 
 
 		 289 aa  136  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  31.88 
 
 		 353 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.1 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  33.46 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  36.69 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  32.04 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  31.29 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  31.87 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  30.23 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.43 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  31.34 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  31.34 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>