More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0840 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0840  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 140 aa  278  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0374  MarR family transcriptional regulator  72.14 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00135193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.38 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 168 aa  120  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  44.62 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  45.08 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  43.61 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 152 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  40 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 144 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 196 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 191 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  40.77 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 		 172 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  40.58 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  40.83 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  35.38 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  46.53 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  37.1 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 267 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  39.23 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  39.23 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1770  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  40.5 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  40.34 
 
 		 195 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 162 aa  98.6  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  43.69 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  37.8 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2330  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.8 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  36.8 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 176 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 185 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27530  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 163 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.037283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  40.65 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 159 aa  95.9  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>