52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  42.48 
 
 		 1042 aa  796    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  48.81 
 
 		 952 aa  878    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  62.82 
 
 		 956 aa  1185    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  49.4 
 
 		 948 aa  883    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  49.46 
 
 		 954 aa  873    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  96.88 
 
 		 983 aa  1884    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  55.37 
 
 		 913 aa  1041    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  49.89 
 
 		 954 aa  873    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  60.73 
 
 		 969 aa  1163    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  55.36 
 
 		 913 aa  1043    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  62.82 
 
 		 962 aa  1187    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  62.82 
 
 		 962 aa  1189    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  62.72 
 
 		 955 aa  1205    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  62.94 
 
 		 963 aa  1185    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  61.77 
 
 		 962 aa  1192    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  61.66 
 
 		 978 aa  1197    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  62.53 
 
 		 960 aa  1177    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  67.83 
 
 		 889 aa  1251    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  62.84 
 
 		 949 aa  1224    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  66.43 
 
 		 1002 aa  1345    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  43.68 
 
 		 908 aa  787    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  56.35 
 
 		 917 aa  1071    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  48.36 
 
 		 941 aa  856    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  61.98 
 
 		 949 aa  1187    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  61.68 
 
 		 960 aa  1194    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  68.4 
 
 		 973 aa  1365    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  62.93 
 
 		 955 aa  1185    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  62.41 
 
 		 963 aa  1177    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  48.36 
 
 		 938 aa  909    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  100 
 
 		 980 aa  2026    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  58.04 
 
 		 659 aa  732    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  37.8 
 
 		 964 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  28.23 
 
 		 924 aa  355  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  27.77 
 
 		 916 aa  343  9e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  27.77 
 
 		 916 aa  343  9e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  53.51 
 
 		 240 aa  269  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  22.91 
 
 		 874 aa  75.1  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  22.07 
 
 		 868 aa  69.3  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  22.92 
 
 		 864 aa  62  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  22.93 
 
 		 847 aa  60.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  20.66 
 
 		 690 aa  58.2  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  22.12 
 
 		 864 aa  53.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  20.57 
 
 		 841 aa  50.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  28.36 
 
 		 816 aa  48.5  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0247  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.76 
 
 		 840 aa  47.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1339  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.76 
 
 		 840 aa  47.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1638  conjugal transfer protein trbE, putative  22.34 
 
 		 840 aa  46.6  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.35 
 
 		 629 aa  46.6  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  22.57 
 
 		 815 aa  45.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  24 
 
 		 803 aa  45.8  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  23.58 
 
 		 908 aa  45.4  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.41 
 
 		 861 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>