More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_29420 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  96.61 
 
 		 413 aa  819    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  846    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3321  dienelactone hydrolase  64.96 
 
 		 409 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  64.88 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  61.5 
 
 		 420 aa  541  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  65.17 
 
 		 411 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  62.65 
 
 		 410 aa  528  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6359  carboxymethylenebutenolidase  62.5 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6771  carboxymethylenebutenolidase  62.25 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5485  carboxymethylenebutenolidase  62.25 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463594  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  62.22 
 
 		 409 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  61.98 
 
 		 409 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  60.88 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  59.95 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  59.7 
 
 		 407 aa  509  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  56.72 
 
 		 408 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  61.28 
 
 		 236 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2716  hypothetical protein  68.93 
 
 		 181 aa  275  9e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0110  hypothetical protein  56.89 
 
 		 193 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05376  conserved hypothetical protein  46.94 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.964155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  46.15 
 
 		 231 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  43.7 
 
 		 235 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  44.8 
 
 		 232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1391  hypothetical protein  50.65 
 
 		 178 aa  182  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2181  carboxymethylenebutenolidase  41.33 
 
 		 250 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00295739  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1605  hypothetical protein  50.65 
 
 		 179 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  42.53 
 
 		 230 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  42.53 
 
 		 230 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  40.87 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  42.53 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  42.08 
 
 		 230 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  44.7 
 
 		 232 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  41.63 
 
 		 230 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07139  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_4G03730)  43.4 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.167964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  39.65 
 
 		 236 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  41.47 
 
 		 232 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  43.91 
 
 		 230 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  43.91 
 
 		 230 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  43.91 
 
 		 230 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  43.91 
 
 		 230 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  43.91 
 
 		 230 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  43.91 
 
 		 230 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  43.91 
 
 		 230 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  39.74 
 
 		 232 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  41.89 
 
 		 233 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  42.08 
 
 		 230 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  42.61 
 
 		 230 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  41.26 
 
 		 232 aa  161  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  38.03 
 
 		 232 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  37.61 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  39.21 
 
 		 237 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  38.03 
 
 		 234 aa  149  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  37.07 
 
 		 248 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  36.04 
 
 		 236 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6316  carboxymethylenebutenolidase  36.87 
 
 		 240 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432921  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6464  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 234 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  38.77 
 
 		 222 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  37.89 
 
 		 223 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  37.39 
 
 		 229 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.97 
 
 		 247 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  33.97 
 
 		 247 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07470  dienelactone hydrolase (AFU_orthologue; AFUA_2G05810)  35.02 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  40 
 
 		 234 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2080  carboxymethylenebutenolidase  38.64 
 
 		 235 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.301648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0255  Carboxymethylenebutenolidase  34.6 
 
 		 229 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  34.6 
 
 		 229 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  36.29 
 
 		 229 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 		 229 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  35.24 
 
 		 223 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  32.54 
 
 		 248 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0900  carboxymethylenebutenolidase  34.8 
 
 		 221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  34.45 
 
 		 248 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  32.23 
 
 		 251 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0275  Carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 		 220 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  31.65 
 
 		 227 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  34.73 
 
 		 229 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3810  carboxymethylenebutenolidase  36.63 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.994218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  32.21 
 
 		 245 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  33.82 
 
 		 246 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0373  carboxymethylenebutenolidase  32.05 
 
 		 230 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  31.44 
 
 		 232 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0137  dienelactone hydrolase  30.66 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2866  dienelactone hydrolase  31.51 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0548  carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.833541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  32.65 
 
 		 244 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  33.19 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  33.19 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  32.76 
 
 		 254 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  29.76 
 
 		 251 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  33.48 
 
 		 295 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01246  carboxymethylenebutenolidase  35.5 
 
 		 191 aa  96.7  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00900  dienelactone hydrolase-like enzyme  32.33 
 
 		 241 aa  96.3  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  30.64 
 
 		 295 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1576  dienelactone hydrolase  32.41 
 
 		 247 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 		 237 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  28.99 
 
 		 227 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  32.64 
 
 		 237 aa  93.2  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3055  Carboxymethylenebutenolidase  30.09 
 
 		 243 aa  92.8  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  32.1 
 
 		 235 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2285  carboxymethylenebutenolidase  27.31 
 
 		 230 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.802761  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>