136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_16371 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_16371  tRNA 2-selenouridine synthase  100 
 
 		 366 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.218284 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1198  tRNA 2-selenouridine synthase  67.99 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1272  tRNA 2-selenouridine synthase  64.33 
 
 		 347 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07211  tRNA 2-selenouridine synthase  57.31 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.989493  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07681  tRNA 2-selenouridine synthase  50.57 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104212  normal  0.0677332 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0136  tRNA 2-selenouridine synthase  51.8 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303131  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0875  tRNA 2-selenouridine synthase  44.12 
 
 		 347 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.303459  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09341  tRNA 2-selenouridine synthase  44.87 
 
 		 346 aa  319  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09351  tRNA 2-selenouridine synthase  44.25 
 
 		 346 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10081  tRNA 2-selenouridine synthase  42.86 
 
 		 350 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.741819  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4284  rhodanese-like protein  44.54 
 
 		 339 aa  279  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00812807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4991  tRNA 2-selenouridine synthase  42.9 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0663375  normal  0.0359024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0278  tRNA 2-selenouridine synthase  45.54 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2386  tRNA 2-selenouridine synthase  41.96 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_002950  PG1887  tRNA 2-selenouridine synthase  39.01 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.739187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0043  tRNA 2-selenouridine synthase  34.72 
 
 		 346 aa  236  7e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2383  tRNA 2-selenouridine synthase  39.87 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14782  predicted protein  35.9 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.597893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3130  tRNA 2-selenouridine synthase  36.07 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000658834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1933  tRNA 2-selenouridine synthase  33.63 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.806249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1525  tRNA 2-selenouridine synthase  37.25 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0672649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2691  tRNA 2-selenouridine synthase  37.25 
 
 		 346 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.7307300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2384  tRNA 2-selenouridine synthase  35.95 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.55321e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3113  tRNA 2-selenouridine synthase  34.63 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.227771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1190  tRNA 2-selenouridine synthase  35.62 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000287258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1023  tRNA 2-selenouridine synthase  33.33 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0985  tRNA 2-selenouridine synthase  29.91 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3619  tRNA 2-selenouridine synthase  35.21 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3301  tRNA 2-selenouridine synthase  33.77 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230491  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1926  tRNA 2-selenouridine synthase  39.08 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0189  tRNA 2-selenouridine synthase  35.07 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0697371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0948  tRNA 2-selenouridine synthase  34.87 
 
 		 338 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0113987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0227  tRNA 2-selenouridine synthase  34.76 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.254912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0160  tRNA 2-selenouridine synthase  34.29 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.334237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0195  tRNA 2-selenouridine synthase  33.53 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2041  tRNA 2-selenouridine synthase  31.66 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0119  tRNA 2-selenouridine synthase  33.14 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3656  tRNA 2-selenouridine synthase  38.78 
 
 		 371 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3754  tRNA 2-selenouridine synthase  36.82 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0900033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2454  tRNA 2-selenouridine synthase  34.41 
 
 		 373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2244  tRNA 2-selenouridine synthase  35.82 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.590434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2327  tRNA 2-selenouridine synthase  31.03 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3539  tRNA 2-selenouridine synthase  33.99 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2803  tRNA 2-selenouridine synthase  33.23 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0769  tRNA 2-selenouridine synthase  34.02 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.649423  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1161  tRNA 2-selenouridine synthase  31.96 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.965775  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1757  tRNA 2-selenouridine synthase  31.86 
 
 		 346 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2396  tRNA 2-selenouridine synthase  32.49 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0822  tRNA 2-selenouridine synthase  32.34 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0849  tRNA 2-selenouridine synthase  32.36 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0863  tRNA 2-selenouridine synthase  32 
 
 		 370 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3480  tRNA 2-selenouridine synthase  32.75 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4342  tRNA 2-selenouridine synthase  33.43 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266604  hitchhiker  0.00245617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3666  tRNA 2-selenouridine synthase  34.15 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3604  tRNA 2-selenouridine synthase  39.06 
 
 		 350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4081  tRNA 2-selenouridine synthase  34.49 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4364  tRNA 2-selenouridine synthase  33.33 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.307655  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0608  tRNA 2-selenouridine synthase  30.03 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0521  tRNA 2-selenouridine synthase  29.91 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3290  tRNA 2-selenouridine synthase  39.06 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0134  tRNA 2-selenouridine synthase  32.95 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0697  tRNA 2-selenouridine synthase  33.06 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.710906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1645  tRNA 2-selenouridine synthase  33.12 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0794  hypothetical protein  32.69 
 
 		 366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0175  tRNA 2-selenouridine synthase  32.75 
 
 		 365 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4183  tRNA 2-selenouridine synthase  37.41 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0172  tRNA 2-selenouridine synthase  36.82 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2556  tRNA 2-selenouridine synthase  31.23 
 
 		 355 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3544  tRNA 2-selenouridine synthase  33.33 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0176  tRNA 2-selenouridine synthase  38.13 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1304  tRNA 2-selenouridine synthase  32.42 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0174  tRNA 2-selenouridine synthase  32.46 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0169  tRNA 2-selenouridine synthase  32.46 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0272703 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1434  tRNA 2-selenouridine synthase  29.43 
 
 		 332 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.719494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4730  tRNA 2-selenouridine synthase  31.29 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.913097  normal  0.697863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1622  tRNA 2-selenouridine synthase  32.75 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2719  tRNA 2-selenouridine synthase  35.26 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0301  tRNA 2-selenouridine synthase  33.33 
 
 		 366 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4714  tRNA 2-selenouridine synthase  32.85 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1955  tRNA 2-selenouridine synthase  30.41 
 
 		 336 aa  142  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.190021  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2715  tRNA 2-selenouridine synthase  34.88 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1349  tRNA 2-selenouridine synthase  35.11 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1545  tRNA 2-selenouridine synthase  31.98 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.256667  normal  0.0827797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3859  tRNA 2-selenouridine synthase  34.87 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6564  tRNA 2-selenouridine synthase  34.39 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0745888  hitchhiker  0.00486619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1488  tRNA 2-selenouridine synthase  31.55 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0285  tRNA 2-selenouridine synthase  31.2 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3629  tRNA 2-selenouridine synthase  31.2 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43270  tRNA 2-selenouridine synthase  31.1 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.829954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10190  tRNA 2-selenouridine synthase  32.17 
 
 		 370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2423  tRNA 2-selenouridine synthase  33.07 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0754  tRNA 2-selenouridine synthase  33.2 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3349  tRNA 2-selenouridine synthase  35.77 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0932  tRNA 2-selenouridine synthase  33.2 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0620  tRNA 2-selenouridine synthase  33.99 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3478  tRNA 2-selenouridine synthase  32.38 
 
 		 348 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.527623 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0765  tRNA 2-selenouridine synthase  33.2 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1508  tRNA 2-selenouridine synthase  30.91 
 
 		 375 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1569  tRNA 2-selenouridine synthase  30.65 
 
 		 375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.866156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1887  tRNA 2-selenouridine synthase  34.26 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227051  normal  0.457474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>