55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_13761 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_13761  AEC family transporter  100 
 
 
261 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13681  AEC family transporter  89.66 
 
 
261 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.02494  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  81.96 
 
 
261 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13471  AEC family transporter  69.58 
 
 
261 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  40.54 
 
 
305 aa  175  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  37.98 
 
 
307 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  38.19 
 
 
305 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  38.19 
 
 
305 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  37.85 
 
 
304 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  33.73 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  27.75 
 
 
306 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  30.41 
 
 
325 aa  58.9  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.79 
 
 
305 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.48 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.13 
 
 
305 aa  55.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.82 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  32.48 
 
 
297 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  26.22 
 
 
320 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.7 
 
 
321 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  22.17 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  26.57 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  22.01 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  31.62 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.07 
 
 
361 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  22.66 
 
 
307 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  27.06 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.81 
 
 
322 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  21.68 
 
 
316 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.39 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  23.5 
 
 
302 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  22.13 
 
 
315 aa  47  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.1 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.79 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  28.68 
 
 
313 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  23.65 
 
 
302 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0068  Auxin Efflux Carrier  34.29 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.723406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  35.29 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  29.46 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  29.46 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  24.89 
 
 
308 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  26.27 
 
 
312 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  22.38 
 
 
307 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  29.46 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  27.94 
 
 
313 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  31.3 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  21.43 
 
 
315 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  25.26 
 
 
329 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  23.85 
 
 
320 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  25.31 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  27.62 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  30.12 
 
 
320 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>