295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3950 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3950  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
778 aa  1563    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.75941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3808  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.04 
 
 
360 aa  79  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3431  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.749704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.49 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0811  glycosyl transferase family 9  30.65 
 
 
331 aa  66.6  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513636  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1601  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.68 
 
 
358 aa  64.7  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1257  glycosyl transferase family 9  33.86 
 
 
375 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492606  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1209  heptosyltransferase  35.04 
 
 
381 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5670  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.74 
 
 
354 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3288  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyltransferase protein  34.48 
 
 
375 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0789  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.83 
 
 
335 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1910  heptosyltransferase family protein  34.31 
 
 
381 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1360  heptosyltransferase family protein  34.31 
 
 
381 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.22 
 
 
352 aa  61.6  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  31.13 
 
 
341 aa  61.6  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1200  heptosyltransferase  34.31 
 
 
359 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0821  heptosyltransferase family protein  34.31 
 
 
359 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1047  heptosyltransferase family protein  34.31 
 
 
359 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0330  heptosyltransferase family protein  34.31 
 
 
359 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.638826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  26.98 
 
 
470 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
294 aa  60.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0262  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  27.03 
 
 
356 aa  60.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0161  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  27.03 
 
 
356 aa  60.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.87 
 
 
339 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
328 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
305 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
296 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0785  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
347 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
528 aa  60.1  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.49 
 
 
343 aa  58.9  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1410  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
367 aa  58.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.242936  normal  0.398938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2700  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.54 
 
 
332 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2795  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.54 
 
 
332 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  23.98 
 
 
361 aa  58.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.01 
 
 
340 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  22.6 
 
 
352 aa  58.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1069  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.75 
 
 
356 aa  57  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
314 aa  57.4  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
361 aa  57.4  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
1152 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  48.28 
 
 
470 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  48.28 
 
 
470 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
1152 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  27.92 
 
 
334 aa  56.6  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  48.28 
 
 
470 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.3 
 
 
346 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  31.21 
 
 
356 aa  55.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  22.83 
 
 
597 aa  55.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3977  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
376 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67849  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3809  glycosyl transferase family 9  30.56 
 
 
381 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.843814  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
357 aa  55.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 
703 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4886  glycosyl transferase family 9  30.56 
 
 
381 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0547939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1297  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.38 
 
 
357 aa  55.8  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
368 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
477 aa  55.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.34 
 
 
336 aa  55.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 
310 aa  55.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1824  glycosyl transferase family 9  30.31 
 
 
390 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0738  putative LPS biosynthesis related glycosyltransferase  31.03 
 
 
347 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.63 
 
 
343 aa  55.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2345  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.17 
 
 
359 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0359  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
402 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4509  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.94 
 
 
358 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
302 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  27.86 
 
 
360 aa  55.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
317 aa  54.7  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  21.96 
 
 
306 aa  54.7  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
348 aa  54.7  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
619 aa  54.7  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  30.07 
 
 
367 aa  54.3  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
293 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.48 
 
 
337 aa  53.9  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
315 aa  53.9  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3702  glycosyl transferase family 9  36.84 
 
 
408 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0578  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
302 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1613  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.52 
 
 
358 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.938574  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.64 
 
 
349 aa  53.9  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
470 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
1035 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 
378 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.9 
 
 
346 aa  54.3  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2661  glycosyl transferase family 9  27.72 
 
 
320 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3011  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
381 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169965  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
513 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
322 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1197  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
323 aa  53.5  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0987  heptosyltransferase family protein  33.33 
 
 
358 aa  53.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  24.73 
 
 
341 aa  53.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.1 
 
 
362 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  30.51 
 
 
371 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.22 
 
 
346 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.45 
 
 
330 aa  52.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3562  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
326 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 
305 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
683 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66250  heptosyltransferase II  25.75 
 
 
345 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1654  glycosyl transferase family 9  26.35 
 
 
383 aa  52.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>