222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3631 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3631  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.66585 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  38.67 
 
 
182 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  37.91 
 
 
183 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 
186 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 
186 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  34.55 
 
 
187 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1764  protein of unknown function DUF179  33.54 
 
 
187 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.619647  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  32.2 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0723  hypothetical protein  37.1 
 
 
196 aa  97.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  37.3 
 
 
192 aa  97.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  33.9 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  35.14 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  38.17 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  32.95 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  35.68 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  27.66 
 
 
209 aa  92.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  32.2 
 
 
182 aa  91.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  34.54 
 
 
196 aa  91.3  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  39.13 
 
 
193 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2223  hypothetical protein  34.46 
 
 
195 aa  90.9  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440526  decreased coverage  0.00358368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  35.16 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  35.98 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2099  hypothetical protein  35.86 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.772524  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0938  hypothetical protein  34.74 
 
 
192 aa  89  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.147168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  33.7 
 
 
191 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0436  hypothetical protein  32.09 
 
 
190 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  38.12 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  33.52 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  35.26 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  33.52 
 
 
186 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  29.55 
 
 
187 aa  87  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  32.45 
 
 
216 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2219  hypothetical protein  30.77 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  32.96 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2193  transcriptional regulator  30.77 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.996839  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  35.29 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  30.9 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  31.94 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  32 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0349  hypothetical protein  31.76 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.242257  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4219  protein of unknown function DUF179  34.55 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0400  hypothetical protein  34.32 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  32.09 
 
 
201 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  32.99 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  27.42 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4502  hypothetical protein  31.72 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0481  hypothetical protein  31.82 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.756128  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0620  hypothetical protein  32.47 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3896  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0636  hypothetical protein  32.47 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0505  hypothetical protein  32.97 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  30.06 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4491  hypothetical protein  32.31 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.460951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5045  hypothetical protein  30.11 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4348  hypothetical protein  31.18 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05290  hypothetical protein  34.15 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.535405  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0681  hypothetical protein  31.15 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2336  hypothetical protein  28.72 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  30.98 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  32.09 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  32.09 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  30.65 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  32.09 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0368  hypothetical protein  32.89 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  32.95 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0547  hypothetical protein  26.44 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  28.06 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  32.16 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  27.01 
 
 
200 aa  77.4  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4995  hypothetical protein  30.11 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  26.94 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2406  protein of unknown function DUF179  31.64 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.802635  normal  0.951535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5395  hypothetical protein  30.43 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5311  hypothetical protein  30.48 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00562319  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  32.16 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2669  protein of unknown function DUF179  32.78 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.670234  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3069  hypothetical protein  30.43 
 
 
206 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4869  hypothetical protein  30.11 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0147719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  29.05 
 
 
198 aa  77  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3062  hypothetical protein  32.78 
 
 
185 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  27.53 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  31.74 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4617  protein of unknown function DUF179  30.98 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  31.74 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1462  hypothetical protein  31.14 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0788  hypothetical protein  30.16 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0916  hypothetical protein  31.74 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2746  hypothetical protein  31.74 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.770221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3112  hypothetical protein  31.74 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3148  hypothetical protein  31.74 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.199133  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1859  hypothetical protein  31.74 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  32.75 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  29.1 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  36.81 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  31.55 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  26.82 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0753  hypothetical protein  30.11 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2524  hypothetical protein  32.74 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.811534  normal  0.166085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>