More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2537 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2537  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  39.18 
 
 
763 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  47.56 
 
 
1402 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  42.53 
 
 
490 aa  67.8  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.54 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  50.72 
 
 
464 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.45 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  36.45 
 
 
285 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  36.45 
 
 
325 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  45.07 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.35 
 
 
685 aa  65.1  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.38 
 
 
490 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.95 
 
 
392 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  44.87 
 
 
557 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.23 
 
 
318 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  47.06 
 
 
489 aa  63.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  46.84 
 
 
789 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  47.95 
 
 
416 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  44.62 
 
 
1493 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  47.14 
 
 
254 aa  62.8  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  35.51 
 
 
327 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  37.23 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  47.76 
 
 
684 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  35.45 
 
 
325 aa  62  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  36.79 
 
 
241 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  46.15 
 
 
208 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  46.38 
 
 
831 aa  61.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  46.38 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.45 
 
 
425 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  40 
 
 
961 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  38.79 
 
 
359 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.29 
 
 
528 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.68 
 
 
1012 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  44.93 
 
 
305 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.77 
 
 
393 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  35.16 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 
181 aa  59.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  41.1 
 
 
376 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6446  Sel1 domain-containing protein  43.02 
 
 
152 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.581642 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.31 
 
 
255 aa  59.3  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0250  Sel1 repeat-containing protein  35.96 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00025154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  35.96 
 
 
301 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.36 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.03 
 
 
341 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.1 
 
 
278 aa  58.2  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  41.98 
 
 
255 aa  58.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  40.96 
 
 
358 aa  58.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  26.61 
 
 
193 aa  58.5  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0907  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.26 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.356696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  33.71 
 
 
331 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  46.05 
 
 
117 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  41.18 
 
 
202 aa  57.8  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  40.3 
 
 
838 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  46.38 
 
 
252 aa  57.8  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  32.58 
 
 
331 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  39.73 
 
 
376 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  42.11 
 
 
342 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.25 
 
 
282 aa  57.4  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.37 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  36.36 
 
 
315 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.33 
 
 
321 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  32.58 
 
 
331 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  41.33 
 
 
552 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  42.65 
 
 
913 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.77 
 
 
346 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.59 
 
 
343 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  40.86 
 
 
1877 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 
448 aa  55.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  42.7 
 
 
303 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 
223 aa  55.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  44.62 
 
 
115 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.85 
 
 
373 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0220  Sel1 repeat-containing protein  44.44 
 
 
276 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  34.29 
 
 
303 aa  55.5  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2699  Sel1 domain-containing protein repeat-containing protein  34.48 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0148338  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  38.03 
 
 
295 aa  55.1  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  36.36 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  44.62 
 
 
218 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  35.45 
 
 
410 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.08 
 
 
230 aa  55.1  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  38.16 
 
 
373 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 
382 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  41.25 
 
 
271 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  31.48 
 
 
137 aa  54.7  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.58 
 
 
331 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  46.38 
 
 
482 aa  54.3  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.42 
 
 
505 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.53 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 
976 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  39.13 
 
 
2413 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  26.85 
 
 
765 aa  53.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.16 
 
 
811 aa  53.9  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0154  Sel1 domain-containing protein  46.03 
 
 
350 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0876617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.33 
 
 
1110 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  38.46 
 
 
1037 aa  53.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3011  Sel1-like  36.96 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.37 
 
 
380 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  37.8 
 
 
693 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  34.88 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>