More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6446 on replicon NC_010518
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010518  Mrad2831_6446  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  313  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.581642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  47.14 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  48.41 
 
 
464 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  51.79 
 
 
316 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.48 
 
 
831 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  42.98 
 
 
557 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.06 
 
 
241 aa  97.4  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  56.14 
 
 
301 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.06 
 
 
684 aa  95.9  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  44.74 
 
 
393 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  36.91 
 
 
490 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.81 
 
 
425 aa  93.6  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  41.07 
 
 
305 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.06 
 
 
489 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  43.36 
 
 
490 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.33 
 
 
341 aa  92.8  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  39.13 
 
 
1493 aa  92.8  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.1 
 
 
789 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  41.44 
 
 
185 aa  91.3  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
448 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  42.24 
 
 
181 aa  90.5  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 
685 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  40 
 
 
1160 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.1 
 
 
1402 aa  88.6  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 
1032 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 
318 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.64 
 
 
346 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.48 
 
 
278 aa  87.4  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  37.72 
 
 
373 aa  87.4  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  39.5 
 
 
961 aa  87  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 
223 aa  86.7  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 
252 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.22 
 
 
343 aa  86.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  36.84 
 
 
373 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  37.29 
 
 
763 aa  85.9  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  39.47 
 
 
1877 aa  85.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  34.92 
 
 
232 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  37.3 
 
 
416 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.23 
 
 
325 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  37.23 
 
 
325 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.21 
 
 
1110 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  38.52 
 
 
285 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  42.27 
 
 
117 aa  84.7  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  37.3 
 
 
376 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.62 
 
 
528 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  39.84 
 
 
256 aa  84.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.66 
 
 
294 aa  84.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  44.66 
 
 
294 aa  84.3  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  40.35 
 
 
509 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  36.29 
 
 
331 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  40.35 
 
 
509 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  40.35 
 
 
509 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 
359 aa  83.6  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  40.35 
 
 
509 aa  83.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  40.52 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  36.51 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  36.44 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  39.84 
 
 
271 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.51 
 
 
1037 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  39.17 
 
 
254 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  33.62 
 
 
331 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  37.12 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  33.62 
 
 
331 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  37.6 
 
 
1105 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  39.2 
 
 
1134 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  37.6 
 
 
1059 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  32.88 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2485  Sel1 domain-containing protein  40.5 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  37.5 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.81 
 
 
358 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  32.76 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.65 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  36.94 
 
 
264 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.4 
 
 
865 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  34.75 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  35.65 
 
 
838 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  38.4 
 
 
1105 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.9 
 
 
850 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.15 
 
 
2413 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  37.01 
 
 
255 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.95 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  38.4 
 
 
1086 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  38.71 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.72 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.4 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.72 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0496  tetratricopeptide repeat family protein  39.22 
 
 
615 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 
976 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  35.65 
 
 
329 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.77 
 
 
342 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  33.06 
 
 
765 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.13 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.66 
 
 
487 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581305  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  36.07 
 
 
680 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  36.67 
 
 
254 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  37.5 
 
 
252 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 
222 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  38.6 
 
 
365 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>