More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3387 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  91.78 
 
 		 353 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3387  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 353 aa  723    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.718202  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  84.14 
 
 		 326 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.22 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.52 
 
 		 349 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2157  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.35 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.523915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.26 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.3 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.73 
 
 		 342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.29 
 
 		 342 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.31 
 
 		 347 aa  322  8e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0367  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.61 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.53 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.35 
 
 		 342 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0638  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.88 
 
 		 347 aa  315  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.531653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 		 338 aa  315  8e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  45.43 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.05 
 
 		 350 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.02 
 
 		 342 aa  308  9e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.76 
 
 		 342 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.95 
 
 		 353 aa  298  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  44.71 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 		 351 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 		 351 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.865242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0067  UDP-glucose 4-epimerase  38.34 
 
 		 346 aa  209  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2038  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.34 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.79 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1046  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  39.8 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4539  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.049862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 		 501 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 		 322 aa  196  7e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.26 
 
 		 459 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.8 
 
 		 510 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2465  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.49 
 
 		 724 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 312 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14191  hypothetical protein  34.1 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14431  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  34.81 
 
 		 315 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5633  putative sugar-nucleotide epimerase/dehydratase  34.08 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 315 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.325994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 		 325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 		 346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.07 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1762  HrEpiB  32.36 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1425  HrEpiB  32.04 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 		 310 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.237262  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  31.01 
 
 		 327 aa  99.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  32.97 
 
 		 318 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  32.95 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  31.3 
 
 		 328 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0958  ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase precursor  25.71 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  26.67 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  28.89 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  30.08 
 
 		 331 aa  90.1  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  31.3 
 
 		 327 aa  89.4  9e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  29.17 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  30.45 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  25.63 
 
 		 328 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  25.93 
 
 		 328 aa  87.4  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  27.64 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 315 aa  87  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  26.27 
 
 		 328 aa  86.7  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  29.73 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 287 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  30.08 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  28.21 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  29.73 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  29.92 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  29 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  30.48 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  28.1 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  28.24 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.58 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  29.48 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>