More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3062 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3062  ABC transporter related  100 
 
 		 525 aa  1061    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.187248  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4757  ABC transporter related  82.55 
 
 		 516 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139896  normal  0.719575 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4656  ABC transporter related  84.72 
 
 		 516 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489627  normal  0.659628 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3768  ABC transporter related  76.49 
 
 		 514 aa  803    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1873  ABC transporter related  52.5 
 
 		 506 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3385  ABC transporter related  52.17 
 
 		 507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3251  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  52.17 
 
 		 507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0913  ribose ABC transporter ATP-binding protein  51.98 
 
 		 507 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2649  ABC transporter related protein  52.17 
 
 		 518 aa  510  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.684281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  47.27 
 
 		 514 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1064  ABC transporter related  48.88 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0465117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0361  ABC transporter related  48.1 
 
 		 515 aa  462  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3638  ABC transporter related  46.4 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0860  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 		 514 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2913  ABC transporter related  47.43 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762867  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1961  ABC transporter related  46.63 
 
 		 512 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1851  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.63 
 
 		 512 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5321  ABC transporter related  46.71 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0567275  normal  0.751648 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0807  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.41753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  42.51 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  41.98 
 
 		 515 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  41.98 
 
 		 515 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 515 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  42.74 
 
 		 495 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1338  ABC transporter related  41.26 
 
 		 515 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.224173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  40.73 
 
 		 516 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  40.73 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  40.73 
 
 		 516 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  40.73 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  41.01 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  40.73 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  41.18 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  40.57 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2999  ABC transporter related protein  40.67 
 
 		 515 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.776135  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.93 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.5 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  40.28 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  41.39 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  40.28 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  40.28 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3337  ABC transporter related  41.78 
 
 		 521 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  41.96 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  40.08 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.28 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3450  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 496 aa  383  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  40.28 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  40.28 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  39.8 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  41.39 
 
 		 520 aa  385  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 525 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  39.4 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  38.22 
 
 		 507 aa  382  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  40.75 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 496 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 528 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  41.25 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.36 
 
 		 501 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  41.85 
 
 		 516 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.55 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  40.6 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 		 523 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4627  ABC transporter related  40.32 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.84 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  38.58 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  39.92 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.04 
 
 		 501 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.24 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  39.72 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  40.2 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 494 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 		 527 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  42.8 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  40.2 
 
 		 499 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  39.84 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19490  ABC transporter related  38.46 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.84 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2301  xylose transporter ATP-binding subunit  38.1 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  39.31 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  40.44 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.98 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  40.44 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.55 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  41.6 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  40.44 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.98 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 494 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  40.2 
 
 		 495 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  41.75 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>