More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1753 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  67.28 
 
 
557 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  93.16 
 
 
559 aa  975    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  67.83 
 
 
557 aa  703    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  68.82 
 
 
557 aa  710    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  93.35 
 
 
559 aa  977    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  72.74 
 
 
558 aa  725    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  100 
 
 
554 aa  1090    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  67.1 
 
 
557 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  62.82 
 
 
555 aa  671    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  61.29 
 
 
562 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  62.5 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  60.32 
 
 
561 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  61.22 
 
 
561 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  60.68 
 
 
561 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  57.71 
 
 
553 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  60.07 
 
 
557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  58.11 
 
 
565 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  60.04 
 
 
557 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  59.96 
 
 
561 aa  597  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  61.4 
 
 
561 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  60.63 
 
 
557 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  57.49 
 
 
554 aa  561  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  58.33 
 
 
566 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  58.33 
 
 
566 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  58.08 
 
 
565 aa  551  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  53.96 
 
 
557 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  51.79 
 
 
553 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  46.9 
 
 
546 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  48.11 
 
 
554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  47.08 
 
 
546 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  49.2 
 
 
577 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  50.54 
 
 
547 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  46.92 
 
 
570 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  45.94 
 
 
549 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  45.67 
 
 
549 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  46.55 
 
 
565 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  45.99 
 
 
546 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  46.5 
 
 
564 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  47.05 
 
 
553 aa  362  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  48.29 
 
 
556 aa  346  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 
559 aa  333  7.000000000000001e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.94 
 
 
589 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  38.15 
 
 
552 aa  330  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  39.18 
 
 
560 aa  326  6e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
549 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  39.79 
 
 
556 aa  321  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  39.67 
 
 
549 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  39.54 
 
 
576 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 
579 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 
549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 
549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  40.18 
 
 
549 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  39.08 
 
 
549 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  39.55 
 
 
568 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  39.3 
 
 
568 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  39.08 
 
 
549 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.33 
 
 
556 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 
579 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  38.79 
 
 
549 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 
579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.91 
 
 
579 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.8 
 
 
557 aa  310  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  40.21 
 
 
569 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  37.12 
 
 
558 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.91 
 
 
579 aa  309  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 
579 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.44 
 
 
608 aa  309  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 
583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 
556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  38.68 
 
 
549 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.57 
 
 
583 aa  306  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 
579 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 
579 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  38.11 
 
 
564 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  35.12 
 
 
557 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 
558 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.81 
 
 
573 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  36.77 
 
 
557 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.47 
 
 
559 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  36.77 
 
 
557 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  33.57 
 
 
559 aa  298  1e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.79 
 
 
554 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  31.7 
 
 
555 aa  298  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.03 
 
 
565 aa  297  4e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  34.77 
 
 
554 aa  297  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.73 
 
 
553 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.73 
 
 
553 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  33.99 
 
 
555 aa  296  5e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.73 
 
 
553 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  33.39 
 
 
554 aa  296  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.8 
 
 
553 aa  296  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  32.97 
 
 
555 aa  296  6e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  36.59 
 
 
557 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.94 
 
 
578 aa  296  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>