More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1524 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1524  transcriptional regulator  100 
 
 
282 aa  577  1.0000000000000001e-163  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0550  transcriptional regulator  49.82 
 
 
284 aa  292  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00967802  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2498  transcriptional regulator  39.93 
 
 
282 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1662  RpiR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2088  RpiR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
284 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0949278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  31.85 
 
 
281 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3077  transcriptional regulator, RpiR family  33.58 
 
 
284 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000143664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  33.21 
 
 
284 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0168  RpiR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
280 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.057217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4022  transcriptional regulator, RpiR family  31.6 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0204031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  29.64 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
284 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2280  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32 
 
 
282 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4516  transcriptional regulator, RpiR family  29.75 
 
 
322 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.36 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  27.47 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7367  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  29.73 
 
 
291 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2756  transcriptional regulator, RpiR family  28.52 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  31.62 
 
 
333 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15700  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.5 
 
 
288 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  29.45 
 
 
318 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0969  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.29 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  30.36 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0269  transcriptional regulator, RpiR family  29.79 
 
 
304 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.409833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
338 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4364  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.92 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1831  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.93 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27270  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.43 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2742  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.88 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.57 
 
 
308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1946  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.89 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23060  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.89 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00612438 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0718  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.57 
 
 
284 aa  132  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02633  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.19 
 
 
284 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2769  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.93 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.00789418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1835  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.59 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2245  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.56 
 
 
289 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2589  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 
289 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00161066  normal  0.817634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1333  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 
289 aa  129  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0116463  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4203  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.95 
 
 
290 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.988768  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2083  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 
289 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.688583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.5 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  30.27 
 
 
292 aa  128  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01824  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.5 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000364184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1787  transcriptional regulator, RpiR family  27.5 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1021  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.95 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1946  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.5 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90466  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01812  hypothetical protein  27.5 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000387969  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3144  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.12 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0232322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2323  putative transcriptional regulator  29.92 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1019  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.95 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150266  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1059  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.95 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629947  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1779  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.5 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0686365  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  29.54 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  29.54 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  29.18 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0668  RpiR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2422  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.86 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0329148  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
273 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2031  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.37 
 
 
284 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0294963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2336  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.760972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  27.24 
 
 
281 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
287 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  29.54 
 
 
287 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1122  RpiR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
285 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1361  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 
289 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  hitchhiker  0.000131827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2049  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.07 
 
 
284 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000665792  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.62 
 
 
286 aa  125  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3209  RpiR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
320 aa  126  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0475  transcriptional regulator, RpiR family  28.57 
 
 
327 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  29.18 
 
 
287 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2101  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 
289 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.928102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2046  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 
289 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.45003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2041  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 
289 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1237  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.14 
 
 
289 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.101978  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1813  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.71 
 
 
284 aa  125  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000867158  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2413  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.5 
 
 
301 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000012699  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2135  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.5 
 
 
301 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2023  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.5 
 
 
289 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.197371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3388  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
284 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
282 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2540  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.71 
 
 
284 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0495107  normal  0.0835263 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1891  DNA-binding transcriptional regulator HexR  26.07 
 
 
284 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
282 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1778  RpiR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
281 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.141472  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1025  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
638 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.745776  normal  0.175715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1119  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.4 
 
 
288 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.942787  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
282 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
282 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
282 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
282 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1299  Hex regulon repressor  28.4 
 
 
288 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.776105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3454  bifunctional glucokinase/RpiR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
638 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454105  normal  0.179776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1865  DNA-binding transcriptional regulator HexR  25.71 
 
 
284 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>