More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1507 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1507  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 370 aa  749    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 370 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0754  AraC family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 365 aa  125  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1455  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  29.29 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 544 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 409 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 273 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0374  transcriptional regulator, AraC family  26.09 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  24.59 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  26.09 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0888  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1795  transcriptional regulator, AraC family  25.58 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  31.63 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 287 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 365 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3211  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 548 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 146 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  25 
 
 		 310 aa  67  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  29.46 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.63 
 
 		 497 aa  66.2  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  28.23 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3753  transcriptional activator RhaR  34.12 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.890732  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05000  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  27.84 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.989106  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0738  transcriptional activator RhaR  34.12 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0386443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  26.99 
 
 		 530 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3841  transcriptional activator RhaR  36.84 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  33 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0209  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  26.78 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1824  two component AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000196685  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3221  transcriptional regulator, AraC family  26.78 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  26.63 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  29 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  28.92 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  22.86 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3607  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  29.17 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 257 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4299  transcriptional activator RhaR  32.65 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0591  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 277 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  26.15 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  20.74 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 255 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03792  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  32.65 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 537 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4078  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 275 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 		 118 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5360  transcriptional activator RhaR  32.65 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  28.21 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4111  transcriptional activator RhaR  32.65 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4136  transcriptional activator RhaR  32.65 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1958  helix-turn-helix domain-containing protein  28.81 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4439  transcriptional activator RhaR  32.65 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.24 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>