111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4699 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4699  ribonuclease P protein component  100 
 
 		 117 aa  222  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4984  ribonuclease P protein component  52.99 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4512  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00356165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3116  ribonuclease P protein  52.21 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3595  ribonuclease P protein component  50.48 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3378  ribonuclease P protein component  52.21 
 
 		 125 aa  94.4  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5095  ribonuclease P protein component  47.06 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9055  ribonuclease P protein  52.88 
 
 		 109 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00175664  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4224  ribonuclease P protein component  50.89 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7099  ribonuclease P protein  56 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3936  ribonuclease P protein component  44.64 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38050  ribonuclease P protein component  51.22 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31970  ribonuclease P protein component  43.52 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2557  ribonuclease P protein component  57.69 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000049885  normal  0.280398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4171  ribonuclease P protein component  41.38 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00326173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6486  ribonuclease P protein  50 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00207284  normal  0.0833987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27030  ribonuclease P protein component  56.52 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5414  ribonuclease P protein component  50.48 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0829  ribonuclease P  38.05 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.861038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6077  ribonuclease P  39.64 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0418194  normal  0.134211 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1438  RNase P protein component  39.47 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23470  ribonuclease P protein component  48.67 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5412  ribonuclease P  40.18 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0007  ribonuclease P  40.18 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0873597  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5788  ribonuclease P  40.18 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534341  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3729  ribonuclease P protein component  54.08 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.468865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13958  ribonuclease P  38.46 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39790  ribonuclease P protein component  53.15 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000138929  normal  0.561767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4027  ribonuclease P  27.35 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5674  ribonuclease P  29.46 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0640013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5638  ribonuclease P  29.46 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5340  ribonuclease P  29.46 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000509102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5168  ribonuclease P  29.46 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5184  ribonuclease P  29.46 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000560819  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5737  ribonuclease P  29.46 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5597  ribonuclease P  29.46 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2949  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000512551  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0047  ribonuclease P protein component  40.85 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4592  ribonuclease P protein component  50.41 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000331999  decreased coverage  0.0000978361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4547  ribonuclease P protein component  52.75 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00136145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5321  ribonuclease P  28.57 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.852432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4960  ribonuclease P protein component  28.18 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123477  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2735  ribonuclease P  27.78 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2792  ribonuclease P  27.78 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.437521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5614  ribonuclease P  28.57 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.234038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4242  ribonuclease P protein component  36.62 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0023987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3215  ribonuclease P protein component  38.53 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5280  ribonuclease P  28.07 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00507948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3644  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00220014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7340  ribonuclease P protein component  46.67 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2576  RNase P protein component  25.89 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5110  ribonuclease P protein component  52.94 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0820058  unclonable  0.0000000144984 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0035  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.309207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0034  ribonuclease P protein component  38.18 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3561  ribonuclease P  29.82 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4863  ribonuclease P protein component  34.75 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0002  ribonuclease P  26.17 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00006762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0408  ribonuclease P  28.24 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0069  ribonuclease P protein component  50.68 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3433  ribonuclease P  30.69 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000048083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4060  ribonuclease P  41.07 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1969  ribonuclease P protein component  38 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.171336  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2721  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0959795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0873  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2315  ribonuclease P  41.35 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2225  ribonuclease P  40.38 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23600  ribonuclease P protein component  26 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000731452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4151  ribonuclease P  60.61 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1060  ribonuclease P protein component  48.65 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2160  ribonuclease P protein component  40.23 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3328  ribonuclease P protein component  29.79 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012018  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1022  ribonuclease P  37.84 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0100  ribonuclease P protein component  43.33 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1539  ribonuclease P protein component  55.88 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000058475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0006  ribonuclease P protein component  39.19 
 
 		 240 aa  43.9  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0503027 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0584  hypothetical protein  55.81 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000000877288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0896  ribonuclease P  27.19 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1256  ribonuclease P protein component  31.82 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000286956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2396  ribonuclease P protein component  37.21 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000617506  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0522  ribonuclease P protein  35.29 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0963  ribonuclease P  37.84 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1368  ribonuclease P protein component  28.04 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.778952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0312  ribonuclease P protein component  55.1 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4708  ribonuclease P  26.83 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1790  ribonuclease P  32.56 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000276815  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2139  ribonuclease P protein component  50 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0604  ribonuclease P protein component  28.21 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00426381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4516  ribonuclease P protein component  40.7 
 
 		 116 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5949  ribonuclease P protein component  38.89 
 
 		 132 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2595  ribonuclease P protein component  31.87 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1047  ribonuclease P  40.62 
 
 		 121 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.012443  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0332  ribonuclease P protein component  67.86 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0356  ribonuclease P protein component  43.33 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274871  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2141  ribonuclease P protein component  38.27 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0093  ribonuclease P protein component  27.27 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0869  ribonuclease P protein component  24.11 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4360  ribonuclease P protein component  39.53 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0219  ribonuclease P protein component  36.05 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0459  ribonuclease P protein component  35 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751226 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1943  ribonuclease P  28.44 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0018816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>