More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4181 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4181  GDP-mannose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 326 aa  674    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2367  GDP-mannose 4,6-dehydratase  75.93 
 
 		 328 aa  518  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1053  GDP-mannose 4,6-dehydratase  68.83 
 
 		 333 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.599891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1307  GDP-mannose 4,6-dehydratase  68.83 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.111837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5498  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.94 
 
 		 329 aa  454  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.0182886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00720  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.83 
 
 		 331 aa  433  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.240367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2084  GDP-mannose 4,6-dehydratase  64.8 
 
 		 324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2872  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.89 
 
 		 340 aa  401  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5497  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.34 
 
 		 323 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8229  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.49 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3928  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.29 
 
 		 324 aa  391  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1711  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.74 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2622  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.63 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00207032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3217  GDP-mannose 4,6-dehydratase  62.34 
 
 		 321 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.76 
 
 		 325 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.54 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0331  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.76 
 
 		 322 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.93 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 		 362 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3187  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.05 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.62 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2780  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.89 
 
 		 329 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 		 359 aa  368  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.44 
 
 		 338 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.27 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1647  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.02 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0567  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.31 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3411  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.06 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.386672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4019  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.33 
 
 		 368 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4472  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.02 
 
 		 328 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.234866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.22 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3292  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.694312  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0508  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.92 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.174744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2890  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 		 343 aa  360  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.657822  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2592  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2977  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.19 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.33 
 
 		 362 aa  358  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 		 349 aa  358  8e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5189  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.35 
 
 		 327 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728187  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.22 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.36 
 
 		 372 aa  354  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71990  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.74 
 
 		 323 aa  351  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.42 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.74 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  53.25 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4280  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.35 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.35 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 		 351 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.6 
 
 		 361 aa  349  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.74 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.27 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.79 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0626  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.47 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1408  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.6 
 
 		 343 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0173  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.35 
 
 		 327 aa  345  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.52 
 
 		 340 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  53.54 
 
 		 348 aa  345  8.999999999999999e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.54 
 
 		 348 aa  345  8.999999999999999e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.31 
 
 		 360 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1429  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.74 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.87 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0652  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.69 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.62 
 
 		 361 aa  342  4e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.09 
 
 		 362 aa  342  5e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.3 
 
 		 368 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01959  GDP-D-mannose dehydratase, NAD(P)-binding  50.28 
 
 		 373 aa  341  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  341  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.878549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2346  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  341  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1179  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  341  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1009  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  341  8e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1588  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  341  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2988  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  341  8e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.02 
 
 		 360 aa  340  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.31 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1799  GDP-mannose 4,6 dehydratase  51.02 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3152  normal  0.0668302 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.92 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5682  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.86 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.87 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.39 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1271  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.45 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0368373 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 373 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0770  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.56 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.179756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0916  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.44 
 
 		 343 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2291  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.76213  normal  0.0141464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.45 
 
 		 360 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.03 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  51.45 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2234  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.712092  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0119174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2335  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.28 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.96 
 
 		 342 aa  338  5e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.21 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.29 
 
 		 360 aa  338  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  50.99 
 
 		 372 aa  338  8e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  54.55 
 
 		 340 aa  338  9e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1523  GDP-mannose 4,6-dehydratase  49.72 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>