64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3507 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3507  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.56 
 
 		 966 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.34 
 
 		 941 aa  110  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  57.78 
 
 		 955 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  56.52 
 
 		 967 aa  103  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.34 
 
 		 966 aa  95.9  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  53.85 
 
 		 955 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.89 
 
 		 928 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.67 
 
 		 934 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.24 
 
 		 973 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.25 
 
 		 992 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  46.15 
 
 		 943 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  42.39 
 
 		 938 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.66 
 
 		 959 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  45.05 
 
 		 937 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  45.05 
 
 		 961 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  38.04 
 
 		 941 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  37.78 
 
 		 944 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.89 
 
 		 938 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.22 
 
 		 941 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.36 
 
 		 936 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0077  FAD linked oxidase-like protein  41.98 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.312559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  43.37 
 
 		 960 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  50.63 
 
 		 955 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  45.26 
 
 		 961 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.67 
 
 		 978 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  49.37 
 
 		 967 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.26 
 
 		 936 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.26 
 
 		 936 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.26 
 
 		 936 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  36.26 
 
 		 959 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  35.87 
 
 		 938 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  37.78 
 
 		 942 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  38.46 
 
 		 951 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  33.7 
 
 		 940 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.76 
 
 		 934 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.56 
 
 		 943 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.5 
 
 		 937 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.43 
 
 		 967 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  35.16 
 
 		 935 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.42 
 
 		 923 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  40.51 
 
 		 949 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.78 
 
 		 942 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.07 
 
 		 939 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 934 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.87 
 
 		 934 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  32.97 
 
 		 914 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 934 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 934 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 934 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 934 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  32.97 
 
 		 934 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  36.14 
 
 		 923 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 934 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  34.94 
 
 		 923 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 934 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4650  hypothetical protein  33.8 
 
 		 446 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.131127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.8 
 
 		 447 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  36.26 
 
 		 983 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1761  hypothetical protein  32.39 
 
 		 447 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3347  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.99 
 
 		 465 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3475  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.58 
 
 		 465 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.839195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3151  hypothetical protein  29.58 
 
 		 465 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1266  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.86 
 
 		 437 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.791395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>