57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0077 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0077  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 
80 aa  164  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.312559  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0072  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  96.05 
 
 
959 aa  156  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0405  FAD linked oxidase-like protein  74.32 
 
 
961 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0118244  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  70.27 
 
 
937 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3604  oxidoreductase  65.38 
 
 
943 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00314932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43110  Fe-S/FAD domain protein  65.79 
 
 
938 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326877  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2196  FAD linked oxidase domain protein  62.03 
 
 
942 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63100  putative ferredoxin  66.22 
 
 
938 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.153244  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1418  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.67 
 
 
943 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4686  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster-binding protein  68.49 
 
 
944 aa  107  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5492  oxidoreductase FAD-binding region  63.51 
 
 
941 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3228  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  65.33 
 
 
978 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0253  oxidoreductase/iron-sulfur cluster-binding protein  63.16 
 
 
959 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4603  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.51 
 
 
936 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52713  normal  0.0292343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4737  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.51 
 
 
936 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0148478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4738  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.51 
 
 
936 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0694  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.51 
 
 
936 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000209119 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0749  FAD linked oxidase-like  61.04 
 
 
940 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1725  FAD linked oxidase domain protein  62.67 
 
 
937 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.250362  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1546  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.81 
 
 
938 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.825134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.89 
 
 
941 aa  100  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.191321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0406  FAD linked oxidase-like  62.67 
 
 
951 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.955894  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1410  4Fe-4S ferredoxin  55.13 
 
 
960 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2281  FAD linked oxidase-like  63.64 
 
 
949 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1439  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.9 
 
 
967 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.96855  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.58 
 
 
934 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2440  iron-sulfur cluster-binding protein  48.68 
 
 
935 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2995  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.48 
 
 
939 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1763  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  45.33 
 
 
923 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.575647  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1521  iron-sulfur cluster-binding protein  44.59 
 
 
914 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3008  FAD linked oxidase domain protein  44.59 
 
 
934 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000527922 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1756  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  50 
 
 
923 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.59 
 
 
934 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1376  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.59 
 
 
934 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.915749 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0908  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.06 
 
 
942 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000203424 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.59 
 
 
934 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2808  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.59 
 
 
934 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1271  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.59 
 
 
934 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0752852  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1936  oxidoreductase, FAD-binding, iron-sulfur cluster-binding  51.32 
 
 
923 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3136  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.21 
 
 
934 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.502756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1353  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.59 
 
 
934 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3063  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 
967 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3171  FAD linked oxidase domain protein  53.42 
 
 
961 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2905  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.59 
 
 
934 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.520733  normal  0.168522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2973  FAD linked oxidase-like  47.5 
 
 
955 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.771032  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13795  predicted protein  50 
 
 
983 aa  67.4  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0857019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2723  FAD linked oxidase-like  42.86 
 
 
955 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3343  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.16 
 
 
934 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.641395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2007  FAD linked oxidase-like  48.57 
 
 
955 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0460  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.21 
 
 
992 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.394566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3728  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.16 
 
 
966 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0224472  normal  0.621627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4141  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.96 
 
 
941 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4837  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.76 
 
 
973 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.286258  hitchhiker  0.00000327471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3507  hypothetical protein  39.24 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33123  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0184  FAD linked oxidase domain protein  36.84 
 
 
967 aa  53.9  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2934  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.47 
 
 
966 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048436  hitchhiker  0.00113857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4610  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.26 
 
 
928 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>