More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3486 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3486  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 		 311 aa  604  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0531  D-alanine/D-alanine ligase  62.5 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00407074  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  46.63 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 		 367 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  42.82 
 
 		 371 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  42.54 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  41.93 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  43.06 
 
 		 384 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  41.16 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  41.71 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  42.65 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  42.27 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  35.93 
 
 		 376 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  34.29 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  35.82 
 
 		 363 aa  201  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  38.5 
 
 		 383 aa  201  9e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  40.45 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  38.87 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  34.58 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  35.85 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  41.06 
 
 		 372 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  38.18 
 
 		 360 aa  199  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  40.34 
 
 		 377 aa  199  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  36.96 
 
 		 360 aa  198  9e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  40.5 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  39.07 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  38.67 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  41.31 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  37.25 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  37.97 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  39.62 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  38.48 
 
 		 358 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0523  D-alanine/D-alanine ligase  40.12 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.346273  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  39 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  36.52 
 
 		 363 aa  193  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  38.26 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  34.82 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  39.41 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  39.28 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  40.95 
 
 		 316 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  40.63 
 
 		 382 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1130  D-alanyl-alanine synthetase A  42.54 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  35.06 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  39.83 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  32.76 
 
 		 361 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  32.76 
 
 		 361 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  32.76 
 
 		 361 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  34.99 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  37.91 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  34.86 
 
 		 360 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  37.31 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  31.95 
 
 		 357 aa  188  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  40.6 
 
 		 346 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  34.99 
 
 		 364 aa  188  9e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  32.75 
 
 		 365 aa  188  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  32.47 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  32.09 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  42.49 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  32.47 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  34.32 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  39.33 
 
 		 400 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  37.7 
 
 		 373 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  36.97 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  37.54 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2148  D-alanine--D-alanine ligase  35.62 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.628633  normal  0.0222251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  35.26 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  34.44 
 
 		 367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  38.85 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  35.73 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  37.01 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  35.16 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  32.46 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  39.36 
 
 		 362 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  34.6 
 
 		 366 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  32.25 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  32.25 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  33.24 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  35.07 
 
 		 359 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  31.81 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  36.71 
 
 		 362 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  31.32 
 
 		 361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  33.62 
 
 		 361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  34.6 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  37.54 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  32.95 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  37.91 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  33.62 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  31.32 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  36.21 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  36.21 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  35.06 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  36.21 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  39.18 
 
 		 376 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  41.69 
 
 		 389 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  37.71 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  35.73 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  35.73 
 
 		 364 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  34.58 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  36.96 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>