More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0531 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0531  D-alanine/D-alanine ligase  100 
 
 		 333 aa  636    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00407074  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3486  D-alanine--D-alanine ligase  62.21 
 
 		 311 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  43.52 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2841  D-alanine/D-alanine ligase  39.94 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  39.55 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  39.55 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  39.39 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  39.83 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  33.99 
 
 		 364 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  38.27 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  34.31 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  37.63 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  39.23 
 
 		 369 aa  185  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  36.69 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  38.46 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  38.06 
 
 		 394 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  32.77 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  33.24 
 
 		 362 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  38.67 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  35.73 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  32.2 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  32.2 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  34.45 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  31.55 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  31.92 
 
 		 361 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  38.46 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  31.92 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  31.92 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  31.92 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  35.71 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  31.92 
 
 		 361 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  32.22 
 
 		 360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  38.55 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  36.54 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  37.33 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  35.82 
 
 		 360 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  32.42 
 
 		 376 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  31.91 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  31.91 
 
 		 364 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  34 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  37.46 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  36.44 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  36.44 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  36.44 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  36.44 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  36.44 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  36.44 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  36.44 
 
 		 364 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  35.06 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  35.77 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  32.32 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  34.84 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  29.91 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  31.36 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0523  D-alanine/D-alanine ligase  36.69 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.346273  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  34.56 
 
 		 364 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  36.2 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  36.46 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  34.28 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  34.28 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  34.28 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  36.78 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  31.03 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  35.47 
 
 		 368 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  31.03 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  37.21 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  30.03 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  30.66 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  35.01 
 
 		 358 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  33.43 
 
 		 341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  35.84 
 
 		 357 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  36.94 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  33.05 
 
 		 351 aa  162  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  37.18 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  32.41 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  36.1 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  33.7 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  33.24 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  36.01 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3672  D-alanine--D-alanine ligase  36.07 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  29.6 
 
 		 353 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0638  D-alanine--D-alanine ligase  36.42 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  38.55 
 
 		 367 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  35.2 
 
 		 377 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  36.97 
 
 		 364 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  30.97 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  32.77 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  32.77 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  34.9 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  37.82 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5793  D-alanine--D-lactate ligase  34.6 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  35.36 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  28.21 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  34.54 
 
 		 366 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  31.52 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4346  D-alanine--D-alanine ligase A  36.76 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1521  D-alanine--D-alanine ligase  36.76 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  36.54 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  34.12 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  36.02 
 
 		 363 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>