More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1623 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0104  cytochrome c oxidase, subunit I  59.04 
 
 		 545 aa  656    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1623  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 561 aa  1118    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  26.71 
 
 		 565 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  25.46 
 
 		 555 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1970  Cytochrome-c oxidase  26.55 
 
 		 614 aa  99  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2966  Cytochrome-c oxidase  23.9 
 
 		 559 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000678538 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  24.86 
 
 		 559 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  24.02 
 
 		 555 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2170  cytochrome c oxidase, subunit I  24.13 
 
 		 598 aa  95.1  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  24.17 
 
 		 554 aa  93.2  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  24.22 
 
 		 553 aa  90.5  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  23.63 
 
 		 562 aa  87.8  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  26.21 
 
 		 638 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  32.21 
 
 		 638 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  23.9 
 
 		 558 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  25.76 
 
 		 638 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  29.36 
 
 		 638 aa  84.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1995  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit I  27.15 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.833948  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1937  cytochrome-c oxidase  24.85 
 
 		 529 aa  82.4  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.034289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  22.51 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12641  cytochrome c oxidase subunit I  27.84 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  29.73 
 
 		 635 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  21.71 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  24.85 
 
 		 562 aa  80.1  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0519  cytochrome c oxidase subunit I type  27.96 
 
 		 562 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  23.08 
 
 		 546 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  23.19 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1356  cytochrome-cbb3 oxidase, subunit I  33.77 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150575  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  23.59 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1332  cytochrome c oxidase subunit I  31.21 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  23.32 
 
 		 552 aa  78.2  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2074  cytochrome c oxidase subunit I  32.48 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1230  cytochrome c oxidase subunit I  31.79 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.28043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  21.36 
 
 		 536 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  22.94 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1238  cytochrome c oxidase, subunit I  29.65 
 
 		 554 aa  77  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.28366 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  26.56 
 
 		 559 aa  77  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  25.48 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  24.65 
 
 		 540 aa  77  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  21.39 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  25.48 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  21.16 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1237  cytochrome c oxidase subunit I  36.42 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.190025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  25.56 
 
 		 541 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  21.21 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  20.96 
 
 		 530 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  25.1 
 
 		 542 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0469  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.25 
 
 		 541 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0256  cytochrome-c oxidase  26.13 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3462  cytochrome-c oxidase  26.13 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2073  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.39 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  21.21 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  22.98 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02054  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  27.17 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.02911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04012  cytochrome c oxidase, subunit I  21.39 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1277  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  32.39 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552433  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  21.39 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  24.55 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  21.39 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1586  cytochrome c oxidase subunit I  33.12 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  21.39 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5935  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.16 
 
 		 539 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.137652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  21.39 
 
 		 530 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6268  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.16 
 
 		 539 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3040  cytochrome c oxidase subunit I  35.19 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0468  cytochrome c oxidase, subunit I  26.42 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1959  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.67 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0873293  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  22.73 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0474  cytochrome c oxidase, subunit I  26.42 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2948  cytochrome c oxidase subunit I  25.81 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0485  cytochrome c oxidase, subunit I  24.32 
 
 		 585 aa  74.3  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4853  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  24.51 
 
 		 667 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2010  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.35 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000523358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3876  cytochrome c oxidase, subunit I  24.05 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1171  cytochrome c oxidase, subunit I  32.69 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  27.62 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0224  cytochrome c oxidase, subunit I  24.62 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0762  cytochrome c oxidase, subunit I  24.62 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0582  cytochrome c oxidase subunit I type  26.42 
 
 		 552 aa  73.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000068814  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  22.53 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  22.34 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1399  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.54 
 
 		 488 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3458  cytochrome c oxidase, subunit I  27.32 
 
 		 542 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2170  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.03 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00937158  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  22.73 
 
 		 539 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  32.16 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4487  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.03 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2201  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.03 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00427716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2220  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.03 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00351736  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  24.81 
 
 		 541 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1250  cytochrome-c oxidase  28.64 
 
 		 628 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.390629  normal  0.863457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  27 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  24.81 
 
 		 541 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2214  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.03 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000199184  normal  0.656675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  25.19 
 
 		 556 aa  73.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1806  cytochrome c oxidase subunit I  34.19 
 
 		 461 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0643  cytochrome c oxidase, subunit I  28.36 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3262  cytochrome c oxidase, subunit I  26.34 
 
 		 542 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  21.16 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2006  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I  26.03 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00103508  hitchhiker  0.0000000337866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>