More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1610 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1610  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.496365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.64 
 
 		 225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  59.55 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  58.18 
 
 		 283 aa  257  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  56.05 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  55.45 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 236 aa  244  6e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  53.36 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1324  response regulator receiver  54.09 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  53.64 
 
 		 235 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.79 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  46.33 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.91 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  49.78 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.43 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 240 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 224 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 224 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1554  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.083917  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  53.39 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 225 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  42.04 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0378  DNA-binding heavy metal response regulator  44.75 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  44.75 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  46.85 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.79 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0344  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.87 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  40.37 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  40.37 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  44.55 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.5 
 
 		 224 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.42 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.89 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.33 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.33 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.33 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.5 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.95 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  45 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.21 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 222 aa  185  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  45.45 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  42.92 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.66 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1381  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.961918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.29 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  43.72 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  42.17 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.5 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.18 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0528  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.74 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  42.92 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1208  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 226 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  45 
 
 		 230 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 226 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.58 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.84 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.84 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.2 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.84 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>