More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1462 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 190 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  58.12 
 
 		 193 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  56.32 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  56.83 
 
 		 194 aa  190  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  49.47 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0743  putative phosphoglycerate mutase family protein  50.54 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.84347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 189 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  55.1 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  54.14 
 
 		 191 aa  178  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  53.51 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  52.38 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  51.89 
 
 		 193 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  50.27 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  49.73 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  48.15 
 
 		 194 aa  171  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  51.06 
 
 		 195 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  49.74 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 202 aa  157  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  51.32 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  49.22 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  45.37 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  50.52 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  49.19 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  46.96 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  45.25 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  49.72 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  49.72 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  49.15 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  45.9 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  45.9 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4679  acid phosphatase  42.37 
 
 		 227 aa  137  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  0.128486 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  34.95 
 
 		 234 aa  131  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  45.36 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  40.78 
 
 		 228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14910  fructose-2,6-bisphosphatase  44.39 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.023343  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  46.58 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  34.1 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  46.36 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  35.02 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  39.31 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1504  broad specificity phosphatase  34.4 
 
 		 237 aa  94  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4366  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.36 
 
 		 378 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.93 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.56 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.9 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.57 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  30.57 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  30.57 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  30.57 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  30.57 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  30.57 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.46 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  38.06 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  31.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.84 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 209 aa  72  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  39.46 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>