More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0834 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  100 
 
 
280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  46.69 
 
 
330 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  46.05 
 
 
314 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0416  flagellar motor protein MotB  47.42 
 
 
318 aa  258  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0032919  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  45.7 
 
 
315 aa  257  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0937  flagellar motor protein MotB  46.15 
 
 
309 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  51.06 
 
 
329 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  45.02 
 
 
308 aa  248  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  45.02 
 
 
308 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  44.33 
 
 
306 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  44.33 
 
 
306 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  44.33 
 
 
306 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2567  flagellar motor protein MotB  43.84 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.72775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2432  flagellar motor protein MotB  44.41 
 
 
312 aa  242  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  43.15 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  43.15 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  43.15 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  43.15 
 
 
310 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1323  flagellar motor protein MotB  43.69 
 
 
305 aa  241  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2767  flagellar motor protein MotB  43.49 
 
 
314 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3474  flagellar motor protein MotB  41.31 
 
 
322 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1847  hitchhiker  0.000424499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1093  flagellar motor protein MotB  42.86 
 
 
314 aa  238  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2786  flagellar motor protein MotB  44.14 
 
 
308 aa  238  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.788875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2987  flagellar motor protein MotB  41.64 
 
 
322 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3325  flagellar motor protein MotB  42.05 
 
 
325 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.391683  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01429  flagellar motor protein MotB  43.51 
 
 
309 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1300  flagellar motor protein MotB  44.72 
 
 
296 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0313  flagellar motor protein MotB  48.09 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1398  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
266 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.370733 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  36.99 
 
 
246 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 
277 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.32 
 
 
263 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  32.68 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 
261 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 
257 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  34.01 
 
 
249 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3028  chemotaxis MotB protein  30.48 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0460  OmpA/MotB  28.41 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  33.6 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  34.17 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  31.2 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0782  OmpA/MotB  33.46 
 
 
256 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0172196  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  32.81 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  32.82 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  33.7 
 
 
305 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  27.78 
 
 
271 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  30.56 
 
 
268 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  30.04 
 
 
338 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2426  OmpA/MotB  32 
 
 
266 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  30.68 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  28.31 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  32.54 
 
 
275 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  31.42 
 
 
248 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  30.62 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1741  OmpA/MotB  31.94 
 
 
244 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595985 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  28.4 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  30.19 
 
 
253 aa  118  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2799  flagellar motor protein MotD  32.68 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.379205  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  42.75 
 
 
460 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  29.96 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0053  OmpA/MotB domain protein  31.27 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  36.2 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  41.4 
 
 
453 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  29.23 
 
 
238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  29.02 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00027  flagellar motor protein MotD  30.71 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170514  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  30.86 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  40.71 
 
 
438 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  40.71 
 
 
438 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  40.71 
 
 
438 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  31.2 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  40.71 
 
 
438 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  28.22 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  29.6 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  40.71 
 
 
438 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  40.71 
 
 
438 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  40.71 
 
 
438 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1325  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
241 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  30.8 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  29.32 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  29.32 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  30.95 
 
 
295 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  40.85 
 
 
430 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  28.85 
 
 
236 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  39.13 
 
 
406 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  44.78 
 
 
449 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  30.12 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  44.78 
 
 
449 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  41.01 
 
 
440 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  28.92 
 
 
262 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  41.43 
 
 
437 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  30 
 
 
262 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  30.4 
 
 
285 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  34.5 
 
 
251 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  33.6 
 
 
259 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  31.23 
 
 
251 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  28.63 
 
 
261 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>