142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2255 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2255  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  550  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0190  hypothetical protein  35 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0849  hypothetical protein  30.85 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0776  integral membrane protein  31.21 
 
 
281 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5086  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 
338 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1593  hypothetical protein  31.4 
 
 
305 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0905154  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4055  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2974  hypothetical protein  30.59 
 
 
319 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000531  permease  28.62 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05355  hypothetical protein  30.34 
 
 
308 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2900  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.554893  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3503  hypothetical protein  30.34 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3280  hypothetical protein  29.17 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.280639  normal  0.696433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5155  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2661  hypothetical protein  31.4 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0546751  normal  0.338735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.12 
 
 
301 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162538  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1093  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.15 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.728348  normal  0.207927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3496  hypothetical protein  26.88 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  28.57 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  29.23 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3071  hypothetical protein  31.23 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0374727  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25.11 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 
327 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
302 aa  55.8  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  25.87 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  31.8 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  25.87 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  33.21 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.58 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.21 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  25.87 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.31 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  26.72 
 
 
312 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.71 
 
 
291 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  26.55 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  26.55 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.5 
 
 
303 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  26.55 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  26.55 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  26.55 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  26.55 
 
 
312 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.5 
 
 
303 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
320 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3160  hypothetical protein  29.78 
 
 
302 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  28.65 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  29.33 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  28.33 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  28.33 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  28.33 
 
 
331 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.86 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  24.77 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.7 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.7 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.7 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  28.94 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  27.91 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  28.48 
 
 
297 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  29.05 
 
 
325 aa  49.3  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  29.41 
 
 
319 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.32 
 
 
286 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.7 
 
 
303 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  29.57 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.28 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.7 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.15 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  29.6 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  30.23 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 
292 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.7 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  24.15 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  32.09 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.7 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.55 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.08 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  24.03 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.39 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  27.8 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.81 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  25.85 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.7 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.09 
 
 
298 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.71 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  27.35 
 
 
310 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.45 
 
 
295 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
299 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.27 
 
 
335 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>