44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0940 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  100 
 
 
350 aa  731    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2970  Wyosine base formation domain protein  84.86 
 
 
345 aa  626  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1206  Wyosine base formation domain protein  73.67 
 
 
325 aa  513  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.770932  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2016  tRNA-modifying enzyme  73.1 
 
 
330 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1006  tRNA-modifying enzyme  49.12 
 
 
345 aa  299  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1737  tRNA-modifying enzyme  45.58 
 
 
316 aa  276  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.210651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  46 
 
 
299 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  45.23 
 
 
297 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0853  tRNA-modifying enzyme  43.51 
 
 
358 aa  249  7e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0476  Wyosine base formation domain protein  46.5 
 
 
308 aa  246  6e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0751  tRNA-modifying enzyme  38.03 
 
 
313 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  43.01 
 
 
306 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1932  Wyosine base formation domain protein  43.15 
 
 
361 aa  231  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.458977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0289  tRNA-modifying enzyme  41.67 
 
 
297 aa  228  9e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0492  tRNA-modifying enzyme  39.71 
 
 
319 aa  226  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.171998  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0272  tRNA-modifying enzyme  40.89 
 
 
303 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.749117  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1529  tRNA-modifying enzyme  35.67 
 
 
341 aa  219  6e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000116298 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0138  tRNA-modifying enzyme  36.39 
 
 
313 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1233  tRNA-modifying enzyme  36.07 
 
 
313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0685  tRNA-modifying enzyme  35.74 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.810972 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1738  tRNA-modifying enzyme  42.91 
 
 
364 aa  212  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1372  tRNA-modifying enzyme  37.2 
 
 
358 aa  205  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.376963  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12352  predicted protein  39.31 
 
 
515 aa  204  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0049294  normal  0.0419453 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67514  Fe-S oxidoreductase  35.83 
 
 
708 aa  202  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0538  tRNA-modifying enzyme  38.85 
 
 
311 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.412175  normal  0.423488 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1016  tRNA-modifying enzyme  37.99 
 
 
351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.486708  hitchhiker  0.000502438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0084  tRNA-modifying enzyme  37.34 
 
 
351 aa  197  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0866  tRNA-modifying enzyme  37.18 
 
 
380 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2206  tRNA-modifying enzyme  38.38 
 
 
358 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.543832 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21682  predicted protein  35.69 
 
 
416 aa  190  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.848598  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00502  flavodoxin and radical SAM domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11510)  35.69 
 
 
786 aa  186  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360604  normal  0.851036 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  24.79 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  23.81 
 
 
304 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 
300 aa  43.9  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 
370 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 
338 aa  43.5  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  24.79 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 
319 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>