50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3841 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  100 
 
 		 895 aa  1825    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2026  hypothetical protein  33.59 
 
 		 897 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.657836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0127  hypothetical protein  27.7 
 
 		 869 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  29.36 
 
 		 833 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  30.04 
 
 		 868 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4992  hypothetical protein  28.81 
 
 		 881 aa  261  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  28.72 
 
 		 878 aa  260  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  28.2 
 
 		 874 aa  253  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  27.13 
 
 		 872 aa  234  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0643  ATPase  25.55 
 
 		 781 aa  232  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  27.67 
 
 		 896 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7587  SMC domain-containing protein  27.89 
 
 		 873 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328529  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3692  hypothetical protein  27.44 
 
 		 891 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000374969 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6595  hypothetical protein  25.8 
 
 		 880 aa  178  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0107  hypothetical protein  25.48 
 
 		 869 aa  164  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  24.59 
 
 		 854 aa  161  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  23.69 
 
 		 887 aa  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  23.69 
 
 		 887 aa  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  35.81 
 
 		 597 aa  95.9  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  22.91 
 
 		 849 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  31.43 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  32 
 
 		 767 aa  54.7  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  32 
 
 		 818 aa  54.3  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  27.57 
 
 		 771 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  31 
 
 		 767 aa  53.5  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3083  hypothetical protein  35 
 
 		 796 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  27.59 
 
 		 771 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  35.96 
 
 		 717 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  33.65 
 
 		 743 aa  49.7  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 770 aa  48.9  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  40.74 
 
 		 643 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.47 
 
 		 402 aa  47.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  40.91 
 
 		 722 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  38.89 
 
 		 710 aa  47.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0892  hypothetical protein  30.21 
 
 		 890 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1494  ABC transporter related  40 
 
 		 482 aa  47.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0334764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2668  hypothetical protein  28.35 
 
 		 695 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  32.14 
 
 		 746 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  37.84 
 
 		 792 aa  46.2  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.14 
 
 		 248 aa  45.4  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  31.25 
 
 		 753 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1603  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 		 481 aa  45.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 227 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 223 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3325  hypothetical protein  30.93 
 
 		 763 aa  44.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  32.76 
 
 		 223 aa  44.7  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  32.76 
 
 		 223 aa  44.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  38.03 
 
 		 792 aa  44.3  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 223 aa  44.3  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5100  SMC domain protein  31.37 
 
 		 676 aa  44.3  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.797675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>