57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4409 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  537  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  42.86 
 
 		 185 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  43.53 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  46.43 
 
 		 179 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  40.21 
 
 		 192 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  41.67 
 
 		 182 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  41.14 
 
 		 186 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  43.27 
 
 		 186 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  38.37 
 
 		 193 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  38.89 
 
 		 190 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  39.46 
 
 		 186 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  40.22 
 
 		 207 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  41.62 
 
 		 212 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  39.56 
 
 		 207 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  37.37 
 
 		 191 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  37.71 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  39.89 
 
 		 219 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  39.89 
 
 		 219 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  40.12 
 
 		 208 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  35.88 
 
 		 186 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  35.84 
 
 		 183 aa  86.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  36.22 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  35.14 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  35.68 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  35.14 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  35.87 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  36.04 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  32.2 
 
 		 186 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  30.32 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  34.09 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  35.22 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  38.01 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  35.96 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  29.21 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  34.48 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  27.6 
 
 		 197 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  28.89 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  33.13 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  31.19 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  31.98 
 
 		 177 aa  55.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  39.83 
 
 		 187 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  28.04 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  24.38 
 
 		 180 aa  52.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  33.63 
 
 		 189 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  26.01 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  32.89 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  32.89 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  32.89 
 
 		 193 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  24.16 
 
 		 192 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  25.75 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  35.11 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  39.6 
 
 		 184 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  28.48 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  33.64 
 
 		 175 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  25.15 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  29.27 
 
 		 164 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>