More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2159 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  61.44 
 
 		 152 aa  184  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  56.29 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  50.33 
 
 		 153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  47.3 
 
 		 173 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  47.71 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  42.76 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 		 203 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  42.36 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 157 aa  117  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  42.67 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  43.84 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1319  transcription regulator AsnC  37.24 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  35.76 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  36.94 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 202 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3095  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679009  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 		 175 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 		 175 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  36.94 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 202 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 229 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  38.03 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40.27 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  34 
 
 		 229 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  35.42 
 
 		 176 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.64 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 174 aa  97.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  97.1  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  97.1  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  31.79 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  41.6 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  37.96 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  37.96 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0662  hypothetical protein  32.47 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  37.23 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  37.96 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.13 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>