More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2126 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
263 aa  521  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  36.33 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 
264 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  34.24 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
265 aa  171  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 
265 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  31.91 
 
 
277 aa  164  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 
265 aa  158  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  36.68 
 
 
264 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
264 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
263 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 
263 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 
263 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  35.97 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 
263 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  36.14 
 
 
263 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  37.96 
 
 
263 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  35.77 
 
 
263 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.07 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  34.08 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  33.72 
 
 
265 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  31.47 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  32.81 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  35.47 
 
 
261 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
264 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  31.62 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 
272 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2317  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0148017 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  33.33 
 
 
328 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  33.08 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  32.96 
 
 
273 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
273 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.96 
 
 
273 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  33.08 
 
 
372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  32.96 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  34.21 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 
235 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
274 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
274 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  34.46 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  36.64 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
285 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
274 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
254 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 
274 aa  111  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  32.42 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  34.25 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  33.98 
 
 
279 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 
278 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  34.5 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.2 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
267 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
266 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
273 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
253 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 
274 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
277 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 
277 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
300 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
274 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
336 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  30.3 
 
 
275 aa  105  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  33.46 
 
 
277 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 
274 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  34.38 
 
 
263 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  33.05 
 
 
392 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  32.64 
 
 
261 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
270 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
264 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  31.01 
 
 
292 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  28.84 
 
 
270 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  34.35 
 
 
259 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
270 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
268 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  32.9 
 
 
275 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 
269 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  29.21 
 
 
270 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  33.9 
 
 
261 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  33.88 
 
 
236 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
277 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
275 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
270 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  30.34 
 
 
275 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
278 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.84 
 
 
270 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>