193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1479 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  100 
 
 
384 aa  728    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  55.26 
 
 
383 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  56.91 
 
 
362 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  54.28 
 
 
376 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  47.94 
 
 
424 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  50.42 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  45.07 
 
 
378 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  39.68 
 
 
400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  38.52 
 
 
387 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1181  peptidase M50  42.51 
 
 
379 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.22871  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  39.55 
 
 
359 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  38.64 
 
 
386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4885  peptidase M50  35.62 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  36.6 
 
 
405 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1856  peptidase M50  40.05 
 
 
377 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2171  peptidase M50  38.16 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  39.06 
 
 
365 aa  173  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  32.04 
 
 
373 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  30.35 
 
 
375 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  31.65 
 
 
374 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  31.65 
 
 
374 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  31.47 
 
 
373 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  32.21 
 
 
396 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  31.02 
 
 
413 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  35.67 
 
 
379 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20920  Zn-dependent protease  36.46 
 
 
380 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.961375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  31.64 
 
 
397 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  32.71 
 
 
412 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  35.92 
 
 
373 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  28.1 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  35.2 
 
 
390 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  36.18 
 
 
376 aa  140  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2244  peptidase M50  38.21 
 
 
373 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  34.6 
 
 
395 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  30.36 
 
 
417 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  29.36 
 
 
374 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  30.36 
 
 
417 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  29.84 
 
 
385 aa  136  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  38.02 
 
 
403 aa  136  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  36.95 
 
 
376 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16220  Zn-dependent protease  30.1 
 
 
395 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.276827  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  29.35 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  34.88 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  27.4 
 
 
370 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  27.04 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  29.25 
 
 
370 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  31.46 
 
 
416 aa  119  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  33.72 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  31.16 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  31.16 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  32.69 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  39.2 
 
 
431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  28.43 
 
 
366 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  34.27 
 
 
390 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  37.36 
 
 
381 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  31.35 
 
 
381 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  28.52 
 
 
393 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  31.27 
 
 
377 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  28.39 
 
 
395 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  32.17 
 
 
388 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  27.2 
 
 
338 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  34.67 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  41.21 
 
 
405 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  35.5 
 
 
373 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  27.03 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  28.52 
 
 
415 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  30.33 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  30.06 
 
 
368 aa  96.3  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  25.48 
 
 
337 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  30.53 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  33.33 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  38.34 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  27.74 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  32.17 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  28.87 
 
 
378 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  31.56 
 
 
384 aa  93.2  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  25.21 
 
 
342 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  35.86 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  37.17 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  35.95 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2977  peptidase M50  43.33 
 
 
378 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00144349  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  29.59 
 
 
380 aa  90.5  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  41.34 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  32.56 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  37.63 
 
 
405 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  33.33 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  29.51 
 
 
285 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  37.43 
 
 
244 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  33.49 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1199  peptidase M50  32.71 
 
 
369 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0242729  normal  0.16524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  32.06 
 
 
239 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  38.29 
 
 
301 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  44.74 
 
 
370 aa  86.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  26.15 
 
 
394 aa  86.7  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  41.36 
 
 
422 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  35.75 
 
 
361 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  40.58 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  36.67 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>