More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4422 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  74.02 
 
 		 460 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  72.93 
 
 		 464 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  73.14 
 
 		 464 aa  659    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  75.76 
 
 		 464 aa  670    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  100 
 
 		 455 aa  907    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  72.53 
 
 		 468 aa  649    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  73.41 
 
 		 457 aa  649    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  75.43 
 
 		 464 aa  668    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  75.55 
 
 		 464 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  72.27 
 
 		 464 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  75.55 
 
 		 464 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  72.75 
 
 		 456 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  73.07 
 
 		 454 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  75.11 
 
 		 464 aa  663    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  70.55 
 
 		 456 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  70.42 
 
 		 456 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0644  cystathionine beta-synthase  71.96 
 
 		 463 aa  632  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  70.02 
 
 		 468 aa  633  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  69.09 
 
 		 456 aa  624  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  68.86 
 
 		 454 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  70.04 
 
 		 455 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  70.33 
 
 		 456 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  69.38 
 
 		 455 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  70.26 
 
 		 465 aa  608  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  68.12 
 
 		 458 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  68.33 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3062  cystathionine beta-synthase  67.25 
 
 		 461 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0923483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2762  cystathionine beta-synthase  64.21 
 
 		 461 aa  584  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  64.43 
 
 		 463 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  64.33 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  54.49 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  48.68 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2956  cystathionine beta-synthase  55.38 
 
 		 465 aa  438  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192465  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5829  cystathionine beta-synthase  47.62 
 
 		 458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.454339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17600  cystathionine beta-synthase  65.62 
 
 		 521 aa  406  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0914  cysteine synthase  64.09 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141926  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1927  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.44 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  46.3 
 
 		 463 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.02 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  43.29 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.28 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  45.28 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.85 
 
 		 459 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1157  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.02 
 
 		 326 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  55.42 
 
 		 326 aa  348  9e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  54.01 
 
 		 332 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00130  cystathionine beta-synthase  51.07 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.61 
 
 		 496 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.05 
 
 		 465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77227  cystathionine beta-synthase  39.96 
 
 		 494 aa  300  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  39.87 
 
 		 459 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  40.09 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08106  putative cystathionine beta-synthase  45.03 
 
 		 345 aa  290  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.46 
 
 		 456 aa  289  9e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  38.7 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  39.87 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1829  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.82 
 
 		 333 aa  286  7e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0936757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  39.43 
 
 		 479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2557  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.99 
 
 		 346 aa  284  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  39.56 
 
 		 454 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_42003  predicted protein  40.34 
 
 		 469 aa  279  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  34.7 
 
 		 466 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0059  putative cystathionine beta-synthase  48.24 
 
 		 316 aa  275  2.0000000000000002e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.857844  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2125  cystathionine beta-synthase  48.24 
 
 		 316 aa  274  3e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.700222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0289  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.13 
 
 		 510 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.16012 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05820  Cystathionine beta-synthase (EC 4.2.1.22) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT5]  44.5 
 
 		 535 aa  272  9e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.555504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1627  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.25 
 
 		 455 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1945  Cysteine synthase  34.78 
 
 		 457 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.01 
 
 		 479 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2430  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family protein  44.86 
 
 		 327 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00735557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.35 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  34.35 
 
 		 456 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2280  cysteine synthase  34.06 
 
 		 459 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2880  hypothetical protein  46.65 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  38.43 
 
 		 456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3022  hypothetical protein  46.33 
 
 		 316 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4194  cysteine synthase  46.03 
 
 		 340 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.360882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  40.17 
 
 		 464 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  44 
 
 		 312 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3855  cysteine synthase  50 
 
 		 344 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.4 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.19 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  45.83 
 
 		 311 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3819  cysteine synthase A  44.76 
 
 		 324 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.96 
 
 		 461 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0170  cysteine synthase family protein  40.26 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  44.48 
 
 		 310 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0276  cysteine synthase A  44.44 
 
 		 324 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  43.33 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  43.33 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.43 
 
 		 307 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  42.57 
 
 		 312 aa  247  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5839  cysteine synthase A  43.73 
 
 		 324 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0281  CBS  33.55 
 
 		 459 aa  246  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0171  cysteine synthase A  42.41 
 
 		 372 aa  246  9e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3360  cysteine synthase A  44.09 
 
 		 324 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.46 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  47.57 
 
 		 310 aa  243  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1804  cysteine synthase A  42.59 
 
 		 334 aa  243  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  42.95 
 
 		 311 aa  243  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>