234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0591 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0591  DoxX family protein  100 
 
 		 147 aa  276  9e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  57.5 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  54.47 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  45.97 
 
 		 148 aa  95.9  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  53.95 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6351  DoxX family protein  43.94 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  43.2 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1588  DoxX family protein  48.78 
 
 		 239 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.014966  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3003  DoxX family protein  46.77 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  40.8 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  39.06 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  39.39 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  53.04 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  43.9 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  35.33 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  36.8 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36.76 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  34.11 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  34.88 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1056  DoxX family protein  40.16 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4520  DoxX family protein  39.13 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4083  DoxX  41.6 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  36.8 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4159  DoxX family protein  41.6 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4313  DoxX family protein  41.6 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2955  Surfeit locus 4-related  39.17 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  40 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.71 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  35.54 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  31.94 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  35.16 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3262  DoxX family protein  39.55 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83259  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2202  DoxX family protein  36.3 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273877  normal  0.79103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  32.64 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4541  DoxX family protein  45.79 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0910404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  32.84 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.89 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  37.12 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  30.07 
 
 		 147 aa  62  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4427  DoxX family protein  46.23 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0606  DoxX family protein  43.24 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  31.94 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  40.7 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0431  DoxX family protein  35.77 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  35.62 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01645  DoxX  38.32 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0455186  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0849  DoxX family protein  39.17 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  42.86 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1442  DoxX family protein  36.79 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  42.5 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  38.4 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  38.93 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4059  DoxX family protein  44.34 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0722  hypothetical protein  50.45 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000540501  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  33.33 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0735  hypothetical protein  50.45 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.7492600000000004e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7264  membrane protein-like protein  44.63 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000149476  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0921  hypothetical protein  50.45 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77995e-43 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6128  hypothetical protein  39.45 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.134606 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  34.65 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4512  DoxX family protein  45.76 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.794637 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0786  hypothetical protein  49.55 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0990  hypothetical protein  49.55 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0667403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0735  DoxX family protein  49.55 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0648582  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0825  hypothetical protein  49.55 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0782  DoxX  35.38 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0879  hypothetical protein  49.55 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4456  hypothetical protein  49.55 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0296685  normal  0.654993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3012  DoxX family protein  35.82 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4442  hypothetical protein  48.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4208  DoxX family protein  48.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.550603  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0206  DoxX family protein  35.57 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  36.22 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  35.17 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1372  DoxX family protein  34.82 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4257  hypothetical protein  48.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4095  hypothetical protein  48.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4106  hypothetical protein  48.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4589  hypothetical protein  48.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4441  hypothetical protein  48.65 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  33.77 
 
 		 378 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1366  DoxX family protein  32.41 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676152 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  32.41 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  34.27 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  31.48 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0756  hypothetical protein  47.75 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  31.25 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4480  hypothetical protein  47.75 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4492  hypothetical protein  47.75 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  33.59 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6484  DoxX family protein  31.3 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  34.81 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0845  DoxD-like family protein  34.21 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3375  DoxX  37.59 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2743  DoxX family protein  35.71 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000157572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  31.72 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  34.72 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  39.84 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>