47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0141 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  100 
 
 		 328 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  28.62 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  27.09 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  30.9 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  26.38 
 
 		 927 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  33.81 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  33.6 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  30.86 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.69 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  26.6 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  26.72 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  28.85 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  29.64 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  30.23 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  30.38 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  27.3 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  30.38 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  29.96 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  24.91 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  28.44 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  27.3 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  22.9 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  32.39 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  31.44 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  24.16 
 
 		 657 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  24.16 
 
 		 657 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  24.16 
 
 		 657 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  24.16 
 
 		 657 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  24.16 
 
 		 657 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  24.16 
 
 		 657 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  23.83 
 
 		 657 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  27.18 
 
 		 667 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  35.29 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  21.7 
 
 		 533 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5035  NHL repeat containing protein  26.32 
 
 		 455 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114728  decreased coverage  0.00343119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  23.2 
 
 		 732 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  32.41 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  19.76 
 
 		 524 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  36.89 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1105  signal transduction histidine kinase-like protein  24.54 
 
 		 1141 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  26.29 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.67 
 
 		 531 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.39 
 
 		 526 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  23.38 
 
 		 2350 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  27.54 
 
 		 214 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  26.42 
 
 		 214 aa  42.7  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.902598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>