43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0766 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0766  type IV secretion system protein VirB4  100 
 
 		 750 aa  1516    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1173  type IV secretion system protein VirB4, putative  23.76 
 
 		 788 aa  192  2e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1041  type IV secretion system protein VirB4  24.22 
 
 		 791 aa  180  8e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0839  type IV secretion system protein VirB5  24.09 
 
 		 791 aa  171  4e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0234971  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0533  type IV secretion system ATPase VirB4  22.37 
 
 		 800 aa  111  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0495  type IV secretion system ATPase VirB4  22.33 
 
 		 800 aa  106  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.97813  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0858  type IV secretion system ATPase VirB4  22.18 
 
 		 801 aa  104  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0677  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.45 
 
 		 796 aa  104  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0255  Type IV secretory pathway AvhB4 protein  23.01 
 
 		 788 aa  104  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.849698 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4445  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.32 
 
 		 803 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.346994  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4346  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.43 
 
 		 793 aa  95.9  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677673  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5086  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.25 
 
 		 790 aa  92  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5816  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  20.53 
 
 		 835 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4376  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.78 
 
 		 785 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851787 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4562  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.07 
 
 		 805 aa  77.8  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733697  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0863  type IV secretion system ATPase VirB4  20.76 
 
 		 803 aa  74.7  0.000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3523  type IV secretion system protein VirB4  22 
 
 		 797 aa  74.3  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6206  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  20.92 
 
 		 839 aa  73.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.623322  normal  0.0559252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2441  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  21.62 
 
 		 815 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06702  normal  0.584537 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5007  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.15 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0207382  normal  0.0996879 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3976  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  21.73 
 
 		 787 aa  68.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3641  CagE TrbE VirB component of type IV transporter system  22.83 
 
 		 791 aa  66.6  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227146 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3819  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  21.62 
 
 		 791 aa  65.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.321786  normal  0.020067 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9821  type IV secretion protein AvhB4  21.1 
 
 		 819 aa  65.1  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4177  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.23 
 
 		 804 aa  63.9  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0870  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  19.93 
 
 		 830 aa  62.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0153  hypothetical protein  21.28 
 
 		 826 aa  61.6  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6405  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.72 
 
 		 819 aa  60.8  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0682909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0171  hypothetical protein  20.67 
 
 		 826 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6159  type IV secretion system protein VirB4  20.27 
 
 		 789 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.0089682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0450  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  21.46 
 
 		 823 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6504  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  22.73 
 
 		 821 aa  53.9  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0163  type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family  21.95 
 
 		 822 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2655  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  22.04 
 
 		 822 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3315  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  19.44 
 
 		 826 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8224  type IV secretion system protein VirB4  20.56 
 
 		 789 aa  52  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4851  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  19.44 
 
 		 826 aa  52  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4200  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  19.67 
 
 		 826 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5026  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system  21.73 
 
 		 804 aa  50.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.451352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1756  putative Type IV secretion system protein VirB4/TraE  21.69 
 
 		 830 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6325  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  20.15 
 
 		 829 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0060  type IV secretion system protein VirB4  18.18 
 
 		 831 aa  47.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0066  type IV secretion system protein VirB4  18.18 
 
 		 831 aa  45.8  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0274973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>