86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0466 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 
369 aa  763    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  36.22 
 
 
399 aa  222  6e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  35.96 
 
 
383 aa  209  4e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  36.06 
 
 
382 aa  209  5e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  32.31 
 
 
450 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  32.59 
 
 
435 aa  195  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  30.67 
 
 
388 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  34.78 
 
 
441 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  32.74 
 
 
417 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  33.08 
 
 
428 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  29.87 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  29.75 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  33.63 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  30.38 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  34.08 
 
 
425 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  30.75 
 
 
471 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  31.46 
 
 
380 aa  182  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  31.55 
 
 
419 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  30.67 
 
 
405 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  31.02 
 
 
387 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  30.47 
 
 
421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  30.95 
 
 
417 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  36.27 
 
 
403 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  31.68 
 
 
416 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  30.28 
 
 
421 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  32.6 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  30.75 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  28.79 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  32.4 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  29.1 
 
 
401 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  29.1 
 
 
401 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  31.86 
 
 
431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  30.92 
 
 
417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.21 
 
 
398 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  29.1 
 
 
401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  29.06 
 
 
424 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  30.87 
 
 
393 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  29.79 
 
 
389 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  30.65 
 
 
407 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  28.93 
 
 
421 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  28.17 
 
 
379 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  28.42 
 
 
379 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  29.02 
 
 
406 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  29.52 
 
 
382 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.07 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  27.22 
 
 
424 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  30.46 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  26.96 
 
 
385 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  28.18 
 
 
420 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  29.28 
 
 
384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  28.72 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  24.87 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  28.72 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  28.57 
 
 
397 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  28.92 
 
 
397 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  27.38 
 
 
382 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  27.38 
 
 
382 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  27.7 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  25 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  30.17 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  27.3 
 
 
390 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  27.12 
 
 
388 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.65 
 
 
392 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  25.61 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  27.67 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  26.48 
 
 
388 aa  97.1  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  26.06 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  26.21 
 
 
315 aa  79.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  26.87 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  23.83 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  23.63 
 
 
479 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  23.26 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  20.88 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  20.88 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  20.88 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  24.62 
 
 
417 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  25.26 
 
 
389 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  26.92 
 
 
368 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  24.83 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  24.64 
 
 
514 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  24.32 
 
 
400 aa  47  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  20.96 
 
 
440 aa  47  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  23.18 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  24 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  21.55 
 
 
562 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  23.62 
 
 
403 aa  42.7  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>