76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5297 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5297  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  863    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  0.0820458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3614  hypothetical protein  94.53 
 
 
466 aa  804    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.456506  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2586  hypothetical protein  78.27 
 
 
430 aa  624  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4725  hypothetical protein  74.65 
 
 
426 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668137  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4699  hypothetical protein  73.72 
 
 
434 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  73.72 
 
 
434 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  73.72 
 
 
434 aa  609  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2897  HNH nuclease  75.24 
 
 
426 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3750  HNH nuclease  74.19 
 
 
436 aa  586  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0508122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2657  hypothetical protein  91.89 
 
 
340 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1606  hypothetical protein  65.89 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1631  hypothetical protein  65.89 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0290  hypothetical protein  67.82 
 
 
411 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0299  hypothetical protein  69.21 
 
 
377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0309  hypothetical protein  69.21 
 
 
377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0869477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11407  hypothetical protein  60.51 
 
 
475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.30083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  60.32 
 
 
424 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1474  hypothetical protein  74.06 
 
 
268 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  42.56 
 
 
547 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  42.39 
 
 
474 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3968  HNH nuclease  49.09 
 
 
457 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.737066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1274  HNH endonuclease  47.19 
 
 
479 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  44.58 
 
 
441 aa  275  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  43.08 
 
 
403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  42.04 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  41.85 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  41.44 
 
 
405 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  41.25 
 
 
410 aa  259  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3360  HNH nuclease  41.35 
 
 
423 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00098079  normal  0.191812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  42.45 
 
 
404 aa  239  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  42.45 
 
 
408 aa  239  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2851  hypothetical protein  40.72 
 
 
437 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000118517  normal  0.0465299 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14290  HNH endonuclease  33.42 
 
 
481 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000128465  normal  0.060373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07870  hypothetical protein  33.49 
 
 
555 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2892  HNH nuclease  40.43 
 
 
256 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00414675  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13330  hypothetical protein  34.26 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.481572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30380  HNH endonuclease  31.83 
 
 
589 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26830  hypothetical protein  30.23 
 
 
494 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23450  HNH endonuclease  31.65 
 
 
541 aa  123  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0981004  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11880  HNH endonuclease  44.72 
 
 
594 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  29.65 
 
 
510 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  26.93 
 
 
567 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  25.09 
 
 
556 aa  67  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.77 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  31.14 
 
 
628 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  24.81 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  24.47 
 
 
508 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  23.53 
 
 
507 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  31.01 
 
 
714 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  32.56 
 
 
551 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  24.43 
 
 
535 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  37.7 
 
 
553 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  29.65 
 
 
580 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  24.21 
 
 
620 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  27.91 
 
 
580 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  23.66 
 
 
566 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  30.32 
 
 
530 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  29.63 
 
 
605 aa  53.1  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  30.77 
 
 
584 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  26.71 
 
 
443 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  25.41 
 
 
568 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  26.46 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  30 
 
 
602 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  27.33 
 
 
558 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  28.14 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  25.68 
 
 
480 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  25.68 
 
 
480 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  32.12 
 
 
748 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  25.14 
 
 
480 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.57 
 
 
512 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  25.41 
 
 
585 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  29.01 
 
 
603 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  26.57 
 
 
511 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  26.57 
 
 
488 aa  44.3  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  31.73 
 
 
473 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>