More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4133 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  73.91 
 
 		 477 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  86.63 
 
 		 483 aa  857    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  86.83 
 
 		 483 aa  858    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  86.83 
 
 		 483 aa  858    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 490 aa  992    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  89.68 
 
 		 478 aa  871    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  50.29 
 
 		 524 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.51 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.51 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.51 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.72 
 
 		 546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.33 
 
 		 510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  48.48 
 
 		 489 aa  435  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.6 
 
 		 526 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  48.4 
 
 		 510 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  48.62 
 
 		 511 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  46.85 
 
 		 512 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  45.33 
 
 		 523 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  47.22 
 
 		 510 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  47.42 
 
 		 508 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.88 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.92 
 
 		 523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.39 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.74 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  42.22 
 
 		 533 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  41.79 
 
 		 543 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 522 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 545 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  48.71 
 
 		 552 aa  319  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  35.7 
 
 		 544 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.02 
 
 		 549 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  33.53 
 
 		 518 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  34.21 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  34.33 
 
 		 560 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  34.14 
 
 		 560 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.86 
 
 		 552 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 553 aa  289  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 539 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 630 aa  289  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.93 
 
 		 514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 560 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 560 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  33.96 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  32.65 
 
 		 560 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 530 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 561 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  31.66 
 
 		 587 aa  280  5e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 547 aa  279  7e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 566 aa  279  9e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  35.42 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 542 aa  277  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 566 aa  276  5e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 843 aa  276  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  33.77 
 
 		 557 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 550 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 557 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 1043 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  32.47 
 
 		 549 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 513 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  32.65 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.21 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 525 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.34 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 506 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 548 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 562 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  34.17 
 
 		 543 aa  270  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 495 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 570 aa  270  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 541 aa  270  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  31.78 
 
 		 550 aa  269  7e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 557 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  34.89 
 
 		 540 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  34.14 
 
 		 564 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 546 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  34.82 
 
 		 547 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.59 
 
 		 512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  32.96 
 
 		 576 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 508 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  34.89 
 
 		 540 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  34.89 
 
 		 540 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 510 aa  266  7e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 		 510 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 		 510 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 		 510 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  30.54 
 
 		 596 aa  266  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 		 510 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 566 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 576 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  33.07 
 
 		 549 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 510 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  33.07 
 
 		 549 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  31.72 
 
 		 549 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>