More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1227 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  50.2 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  44.49 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  39.26 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  44.19 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  36.82 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  38.08 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 259 aa  174  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  40.93 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  31.44 
 
 		 289 aa  78.6  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.84 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.79 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.8 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.4 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.29 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.17 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.8 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.37 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  31.56 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.98 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.26 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.79 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.69 
 
 		 360 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  29.15 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  26.44 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.04 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.5 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 375 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  26.8 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  26.53 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  27.01 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  24.3 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  30.36 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.89 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 358 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  24 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  24 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  25.65 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.59 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  22.3 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.28 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  28.09 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  28.09 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  30.36 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  25.53 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  27.44 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  28.07 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  24.51 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  27.53 
 
 		 339 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.57 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  27.53 
 
 		 339 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  23.2 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0773  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems permease component  27.91 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  29.87 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  24.77 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 339 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 		 372 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 367 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  24.26 
 
 		 379 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>