60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0976 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0976  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 125 aa  250  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2923  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  44.95 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0830145  hitchhiker  0.000724487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0337  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  41.18 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0344  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  37.1 
 
 		 128 aa  83.6  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0493  molydopterin dinucleotide-binding region  35.48 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0561  molydopterin dinucleotide-binding region  33.87 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1426  molydopterin dinucleotide-binding region  34.68 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1984  molydopterin dinucleotide-binding region  30.89 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0243  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  32.71 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.208129  normal  0.212279 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2236  molydopterin dinucleotide-binding region  30.95 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.0387564 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1095  molydopterin dinucleotide-binding region  27.5 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0621  molydopterin dinucleotide-binding region  31.86 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0101  molydopterin dinucleotide-binding region  28.95 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.526644  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1463  molydopterin dinucleotide-binding region  28.95 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2107  molydopterin dinucleotide-binding region  34.13 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2237  molydopterin dinucleotide-binding region  32.71 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.0380736 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1389  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit B  33.66 
 
 		 574 aa  61.6  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1987  molydopterin dinucleotide-binding region  26.4 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.295284  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0878  molydopterin dinucleotide-binding region  30.63 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1186  molydopterin dinucleotide-binding region  27.64 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0619924  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1993  molydopterin dinucleotide-binding region  28.81 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0699041  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1291  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  30.19 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0204  molydopterin dinucleotide-binding region  27.1 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0715847 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1470  molydopterin dinucleotide-binding region  27.62 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0373  molydopterin dinucleotide-binding region  28.46 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.827239  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 955 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0282  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit D  27.88 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1829  molydopterin dinucleotide-binding region  32.43 
 
 		 587 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  45.45 
 
 		 762 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4690  molybdopterin oxidoreductase  40 
 
 		 863 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000953004  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.8 
 
 		 668 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  37.5 
 
 		 755 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.27 
 
 		 1000 aa  43.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.26 
 
 		 688 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1404  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  35.85 
 
 		 790 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.94 
 
 		 723 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.29 
 
 		 888 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0359  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  36 
 
 		 816 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0222521  hitchhiker  0.00628984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  38 
 
 		 697 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.94 
 
 		 911 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  44 
 
 		 822 aa  42  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.11 
 
 		 674 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3861  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  36 
 
 		 816 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187524  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.11 
 
 		 674 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.11 
 
 		 674 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  45.65 
 
 		 1257 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2338  molybdopterin oxidoreductase  38.46 
 
 		 884 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  32.79 
 
 		 635 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2346  molybdopterin oxidoreductase  37.04 
 
 		 879 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.951225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.53 
 
 		 893 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3639  molybdopterin oxidoreductase  50 
 
 		 843 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.424964  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  34.18 
 
 		 647 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  30.95 
 
 		 425 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  36 
 
 		 703 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  34.62 
 
 		 752 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  36 
 
 		 753 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  40.43 
 
 		 950 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  38.64 
 
 		 771 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  32.2 
 
 		 821 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  30.49 
 
 		 559 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>